NCBI C++ ToolKit
Functions | Variables
unit_test_uncultured_taxlookup.cpp File Reference
#include <ncbi_pch.hpp>
#include <objects/seqfeat/BioSource.hpp>
#include <objects/seqfeat/Org_ref.hpp>
#include <objects/seqfeat/SubSource.hpp>
#include <objects/seqfeat/OrgMod.hpp>
#include <objects/seqfeat/OrgName.hpp>
#include <corelib/test_boost.hpp>
#include <gui/objutils/macro_util.hpp>
#include <gui/objutils/macro_fn_aecr.hpp>
#include <gui/objutils/macro_fn_lookup.hpp>
#include <gui/objutils/macro_fn_feature.hpp>
#include <gui/objutils/macro_fn_pubfields.hpp>
+ Include dependency graph for unit_test_uncultured_taxlookup.cpp:

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Functions

 USING_SCOPE (objects)
 
 USING_SCOPE (macro)
 
 NCBITEST_AUTO_INIT ()
 
 NCBITEST_AUTO_FINI ()
 
template<class T >
string MakeAsn (const T &object)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_TaxnameCorrections)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_Taxon1)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_Taxon2)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_Taxon3)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_Taxon4)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific1)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific2)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific3)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific4)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific_Misspelled)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NoteInPlace)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific1)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific2)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific3)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_OrgModQualifiers)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_UniversalPrimers1)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_UniversalPrimers2)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NoTaxId1)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_UncultTaxTool_NoTaxId2)
 
 BOOST_AUTO_TEST_CASE (Test_CulturedTaxTool_TaxnameCorrections)
 

Variables

 USING_NCBI_SCOPE
 
static const string uncultured_taxnames []
 
static const string uncultured_suggestions []
 

Function Documentation

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [1/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_CulturedTaxTool_TaxnameCorrections  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [2/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NoTaxId1  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [3/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NoTaxId2  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [4/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NoteInPlace  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [5/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific1  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [6/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific2  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [7/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_NotSpeciesSpecific3  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [8/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_OrgModQualifiers  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [9/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific1  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [10/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific2  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [11/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific3  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [12/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific4  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [13/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_SpeciesSpecific_Misspelled  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [14/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_TaxnameCorrections  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [15/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_Taxon1  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [16/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_Taxon2  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [17/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_Taxon3  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [18/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_Taxon4  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [19/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_UniversalPrimers1  )

◆ BOOST_AUTO_TEST_CASE() [20/20]

BOOST_AUTO_TEST_CASE ( Test_UncultTaxTool_UniversalPrimers2  )

◆ MakeAsn()

template<class T >
string MakeAsn ( const T object)

Definition at line 169 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

References MSerial_AsnText, and str().

Referenced by BOOST_AUTO_TEST_CASE().

◆ NCBITEST_AUTO_FINI()

NCBITEST_AUTO_FINI ( )

Definition at line 56 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

◆ NCBITEST_AUTO_INIT()

NCBITEST_AUTO_INIT ( )

Definition at line 52 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

◆ USING_SCOPE() [1/2]

USING_SCOPE ( macro  )

◆ USING_SCOPE() [2/2]

USING_SCOPE ( objects  )

Variable Documentation

◆ uncultured_suggestions

const string uncultured_suggestions[]
static

Definition at line 114 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

Referenced by BOOST_AUTO_TEST_CASE().

◆ uncultured_taxnames

const string uncultured_taxnames[]
static

Definition at line 60 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

Referenced by BOOST_AUTO_TEST_CASE().

◆ USING_NCBI_SCOPE

USING_NCBI_SCOPE

Definition at line 48 of file unit_test_uncultured_taxlookup.cpp.

Modified on Fri Jan 05 07:25:00 2024 by modify_doxy.py rev. 669887