Link to NCBI Front Page Taxonomy Logo
Entrez PubMed Nucleotide Protein Genome Structure PMC Taxonomy BioCollections
   
Taxonomy browser (Clonorchis sinensis)

Clonorchis sinensis

Taxonomy ID: 79923 (for references in articles please use NCBI:txid79923)
current name
Clonorchis sinensis (Cobbold, 1875)
NCBI BLAST name: flatworms
Rank: species
Genetic code: Translation table 1 (Standard)
Mitochondrial genetic code: Translation table 9 (Echinoderm Mitochondrial; Flatworm Mitochondrial)
Other names:
common name(s) oriental liver fluke
Lineage( full )
cellular organisms; Eukaryota; Opisthokonta; Metazoa; Eumetazoa; Bilateria; Protostomia; Spiralia; Lophotrochozoa; Platyhelminthes; Trematoda; Digenea; Opisthorchiida; Opisthorchiata; Opisthorchiidae; Clonorchis
   Entrez records   
Database name Direct links
Nucleotide 117,904
Protein 30,977
Structure 6
Genome 1
Popset 28
GEO Datasets 21
PubMed Central 2,180
Gene 12
SRA Experiments 184
Protein Clusters 12
Identical Protein Groups 27,373
BioProject 13
BioSample 183
Assembly 3
PubChem BioAssay 2
Taxonomy 1

Comments and References:

image:Clonorchis sinensis

Genome Information

Go to NCBI genomic BLAST page for Clonorchis sinensis

External Information Resources (NCBI LinkOut)

LinkOut Subject LinkOut Provider
Clonorchis sinensis taxonomy/phylogenetic Animal Diversity Web
Clonorchis sinensis taxonomy taxonomy/phylogenetic Arctos Specimen Database
Clonorchis sinensis taxonomy/phylogenetic Encyclopedia of life
2 records from this provider organism-specific Genomes On Line Database
Show Biotic Interactions taxonomy/phylogenetic Global Biotic Interactions
Clonorchis sinensis taxonomy/phylogenetic Integrated Taxonomic Information System
WebScipio: Clonorchis sinensis organism-specific WebScipio - eukaryotic gene identification
diArk: Clonorchis sinensis organism-specific diArk - a resource for eukaryotic genome research
Wikipedia taxonomy/phylogenetic iPhylo
Notes:
Groups interested in participating in the LinkOut program should visit the LinkOut home page.
A list of our current non-bibliographic LinkOut providers can be found here.

Information from sequence entries

Organism modifiers

To hide organism modifiers click here
strain
1 [1] 2 [1] 230 [1] 30T1C [1]
CsNA [1 1] CsTH [1 1] Henan [1 2555 13634] JH13 [1]
JH24 [1] JH4 [1] JH49 [1] JH7 [1]
JH75 [1] Kwang-si [1] ND [4 5] NH [2 2]
VNM [2]
isolate
1 [16 1 13] 1.1 [1 1 1] 1.10 [1 1 1] 1.11 [1 1 1]
1.12 [1 1 1] 1.13 [1 1 1] 1.14 [1 1 1] 1.15 [1 1 1]
1.16 [1 1 1] 1.17 [1 1 1] 1.2 [1 1 1] 1.7 [1 1 1]
1.8 [1 1 1] 1.9 [1 1 1] 10 [1] 11 [1]
18.1 [2 2 1] 18.10 [2 2 1] 18.11 [2 2 1] 18.12 [2 2 1]
18.13 [2 2 1] 18.2 [2 2 1] 18.3 [2 2 1] 18.4 [2 2 1]
18.5 [2 2 1] 18.6 [2 2 1] 18.7 [2 2 1] 18.8 [2 2 1]
18.9 [2 2 1] 18S-C.S-18S-F_F11 [1 1] 18s-C.S-18s-F_A01 [1 1] 18s-C.S-2-18s-F_A03 [1 1]
2 [18 2 15] 2.1 [1 1 1] 2.10 [1 1 1] 2.11 [1 1 1]
2.12 [1 1 1] 2.13 [1 1 1] 2.14 [1 1 1] 2.15 [1 1 1]
2.16 [1 1 1] 2.17 [1 1 1] 2.18 [1 1 1] 2.19 [1 1 1]
2.2 [1 1 1] 2.7 [1 1 1] 2.8 [1 1 1] 2.9 [1 1 1]
24.1 [2 2 1] 24.10 [2 2 1] 24.11 [2 2 1] 24.12 [2 2 1]
24.13 [2 2 1] 24.2 [2 2 1] 24.3 [2 2 1] 24.4 [2 2 1]
24.5 [2 2 1] 24.6 [2 2 1] 24.7 [2 2 1] 24.8 [2 2 1]
24.9 [2 2 1] 26.1 [2 2 1] 26.11 [2 2 1] 26.12 [2 2 1]
26.13 [2 2 1] 26.14 [2 2 1] 26.2 [2 2 1] 26.3 [2 2 1]
26.4 [2 2 1] 26.5 [2 2 1] 26.6 [2 2 1] 26.7 [2 2 1]
26.8 [2 2 1] 26.9 [2 2 1] 3 [18 1 17] 3.1 [1 1 1]
3.10 [1 1 1] 3.11 [1 1 1] 3.12 [1 1 1] 3.13 [1 1 1]
3.14 [1 1 1] 3.15 [1 1 1] 3.16 [1 1 1] 3.17 [1 1 1]
3.2 [1 1 1] 3.3 [1 1 1] 3.4 [1 1 1] 3.5 [1 1 1]
3.6 [1 1 1] 3.7 [1 1 1] 3.8 [1 1 1] 3.9 [1 1 1]
34.1 [1 1 1] 34.10 [1 1 1] 34.11 [1 1 1] 34.12 [1 1 1]
34.2 [1 1 1] 34.3 [1 1 1] 34.4 [1 1 1] 34.5 [1 1 1]
34.6 [1 1 1] 34.8 [1 1 1] 34.9 [1 1 1] 4 [1]
42.1 [1 1 1] 42.3 [1 1 1] 5 [1] 6 [1]
7 [1] 8 [1] 9 [1] ADF1 [2 2]
Adult samples1 [1] Andong1 [2 1] BAU_CS.cox1.1 [1 1] BAU_CS.cox1.2 [1 1]
BAU_CS.cox1.3 [1 1] Binxian [1] C1121 [1] C1132 [1]
C123-1 [1] CDJ [1] CG7.1 [1 1 1] CG7.2 [1 1 1]
CS11.1 [1 1 1] CS11.2 [1 1 1] CS11.3 [1 1 1] CS11.4 [1 1 1]
CS11.6 [1 1 1] CS12.11 [1 1 1] CS12.12 [1 1 1] CS12.3 [1 1 1]
CS12.4 [1 1 1] CS12.8 [1 1 1] CS4 [2 13] CS46 [2 13]
CSA [1 1] CSAH1 [1 1] CSAH2 [1 1] CSAH3 [1 1]
CSAH4 [1 1] CSAH5 [1 1] CSAH6 [1 1] CSAH7 [1 1]
CSAH8 [1 1] CSB [1 1] CSC [1 1] CSCS8 [1 1 1]
CSCSC6 [1 1 1] CSCSC8 [1 1 1] CSCZ3 [1 1 1] CSCZD2 [2 2 2]
CSCZD3 [2 2 2] CSD [1 1] CSDQ1 [3 2] CSDQ2 [3 2]
CSDQ3 [3 2] CSDQ4 [3 2] CSDQ5 [3 2] CSDQ6 [3 2]
CSDQ7 [3 2] CSE [1 1] CSFSC14 [1 1 1] CSFSC17-1 [3 3 3]
CSFSC19-2 [2 2 2] CSFSD10 [4 4 4] CSFSD16-1 [4 4 4] CSGD1 [1 1]
CSGD2 [1 1] CSGD3 [1 1] CSGD4 [1 1] CSGD5 [1 1]
CSGD6 [1 1] CSGD7 [1 1] CSGD8 [1 1] CSGDMZ1 [4 4 4]
CSGDQY1 [4 4 4] CSGDQY2 [4 4 4] CSGDQY3 [4 4 4] CSGDSZ1 [4 4 4]
CSGDSZ2 [4 4 4] CSGDSZ3 [4 4 4] CSGDYC1 [4 4 4] CSGDYC2 [4 4 4]
CSGDYC3 [4 4 4] CSGDZQ1 [4 4 4] CSGDZQ2 [4 4 4] CSGDZQ3 [4 4 4]
CSGX1 [1 1] CSGX2 [1 1] CSGX3 [1 1] CSGX4 [1 1]
CSGX5 [1 1] CSGX6 [1 1] CSGX7 [1 1] CSGX8 [1 1]
CSGXNN1 [4 4 4] CSGXNN2 [4 4 4] CSGXNN3 [4 4 4] CSGZ1 [3 2]
CSGZ2 [3 2] CSGZ3 [3 2] CSGZ4 [3 2] CSGZ5 [3 2]
CSGZ6 [3 2] CSGZ7 [3 2] CSHB1 [1 1] CSHB2 [1 1]
CSHB3 [1 1] CSHB4 [1 1] CSHB5 [1 1] CSHB6 [1 1]
CSHB7 [1 1] CSHB8 [1 1] CSHB9 [1 1] CSHLJ1 [1 1]
CSHLJ2 [1 1] CSHLJ3 [1 1] CSHLJ4 [1 1] CSHLJ5 [1 1]
CSHLJ6 [1 1] CSHLJ7 [1 1] CSHLJ8 [1 1] CSHN1 [1 1]
CSHN2 [1 1] CSHN3 [1 1] CSHN4 [1 1] CSHN5 [1 1]
CSHN6 [1 1] CSHN7 [1 1] CSHN8 [1 1] CSHP6 [4 4 4]
CSHP8 [4 4 4] CSHP9 [4 4 4] CSHUN1 [1 1] CSHUN2 [1 1]
CSHUN3 [1 1] CSHUN4 [1 1] CSHUN5 [1 1] CSHUN6 [1 1]
CSHUN7 [1 1] CSHUN8 [1 1] CSHbHb01_21 [1 1 1] CSJL1 [1 1]
CSJL2 [1 1] CSJL3 [1 1] CSJL4 [1 1] CSJL5 [1 1]
CSJL6 [1 1] CSJMS1 [3 2] CSJMS2 [3 2] CSJMS3 [3 2]
CSJMS4 [3 2] CSJMS5 [3 2] CSJMS6 [3 2] CSJMS7 [3 2]
CSJS1 [1 1] CSJS2 [1 1] CSJS3 [1 1] CSJS4 [1 1]
CSJS5 [1 1] CSJS6 [1 1] CSJS7 [1 1] CSJX1 [2 1 1]
CSJX2 [1 1] CSJX3 [1 1] CSJX4 [1 1] CSJX5 [1 1]
CSJX6 [1 1] CSNN1 [3 2] CSNN2 [3 2] CSNN3 [3 2]
CSNN4 [3 2] CSNN5 [3 2] CSNN6 [3 2] CSNN7 [3 2]
CSSGD11-2 [3 3 3] CSSGD12-1 [4 4 4] CSSGD13-2 [1 1 1] CSSGD3-2 [4 4 4]
CSXXC2 [1 1 1] CSXXC5-2 [4 4 4] CSXXC7-2 [3 3 3] CSXXD12-2 [4 4 4]
CSXXD5-1 [4 4 4] CSZJ1 [1 1] CSZJ2 [1 1] CSZJ3 [1 1]
CSZJ4 [1 1] CSZJ5 [1 1] CSZJ6 [1 1] CS_A_CHN1 [1 1]
CS_A_GH1 [1 1] CS_A_GR1 [1 1] CS_A_GR2 [1 1] CS_A_GR3 [1 1]
CS_A_JJ1 [1 1] CS_A_JJ2 [1 1] CS_A_JJ3 [1 1] CS_BAU.1 [1]
CS_BAU.2 [1] CS_BAU.3 [1] CS_BAU.4 [1] CS_BAU.5 [1]
CS_BAU.6 [1] CS_BAU.7 [1] CS_B_CHN2 [1 1] CS_B_GH2 [1 1]
CS_B_GH3 [1 1] CS_B_JJ4 [1 1] CS_B_JJ5 [1 1] CS_C_CHN3 [1 1]
CS_C_CHN4 [1 1] CS_C_CHN5 [1 1] CS_C_JJ6 [1 1] CS_D_JJ7 [1 1]
CS_D_JJ8 [1 1] CS_E_CHN6 [1 1] CS_F_CHN7 [1 1] CS_G_CHN8 [1 1]
ChangChun [2] China-guangxi [3] China-shenyang [2] Chinese [2 2]
Ci1 [1] Ci102 [1] Ci11 [1] Ci111 [1]
Ci12 [1] Ci122 [1] Ci13 [1] Ci131 [1]
Ci14-1 [1] Ci14-2 [1] Ci16 [1] Ci18 [1]
Ci19 [1] Ci2 [1] Ci23-2 [1] Ci24 [1]
Ci32 [1] Ci4 [1] Ci5 [1] Ci72 [1]
Cs-HP1 [1 1] Cs-k2 [1 1 80 14420 10] Cs1 [1 12] Cs100 [1 12]
Cs101 [1 12] Cs102 [1 12] Cs105 [1 12] Cs106 [1 12]
Cs107 [1 12] Cs108 [1 12] Cs109 [1 12] Cs11 [1 12]
Cs110 [1 12] Cs111 [1 12] Cs112 [1 12] Cs113 [1 12]
Cs114 [1 12] Cs115 [1 12] Cs116 [1 12] Cs117 [1 12]
Cs118 [1 12] Cs119 [1 12] Cs12 [1 12] Cs121 [1 12]
Cs122 [1 12] Cs123 [1 12] Cs124 [1 12] Cs125 [1 12]
Cs126 [1 12] Cs127 [1 12] Cs128 [1 12] Cs129 [1 12]
Cs13 [1 12] Cs130 [1 12] Cs131 [1 12] Cs134 [1 12]
Cs135 [1 12] Cs136 [1 12] Cs137 [1 12] Cs138 [1 12]
Cs139 [1 12] Cs140 [1 12] Cs141 [1 12] Cs143 [1 12]
Cs144 [1 12] Cs145 [1 12] Cs146 [1 12] Cs15 [1 12]
Cs150 [1 12] Cs151 [1 12] Cs152 [1 12] Cs153 [1 12]
Cs154 [1 12] Cs155 [1 12] Cs156 [1 12] Cs157 [1 12]
Cs158 [1 12] Cs159 [1 12] Cs160 [1 12] Cs162 [1 12]
Cs167 [1 12] Cs168 [1 12] Cs169 [1 12] Cs17 [1 12]
Cs171 [1 12] Cs172 [1 12] Cs174 [1 12] Cs176 [1 12]
Cs177 [1 12] Cs178 [1 12] Cs179 [1 12] Cs18 [1 12]
Cs180 [1 12] Cs181 [1 12] Cs182 [1 12] Cs183 [1 12]
Cs184 [1 12] Cs185 [1 12] Cs186 [1 12] Cs187 [1 12]
Cs188 [1 12] Cs189 [1 12] Cs190 [1 12] Cs191 [1 12]
Cs192 [1 12] Cs193 [1 12] Cs194 [1 12] Cs195 [1 12]
Cs196 [1 12] Cs197 [1 12] Cs198 [1 12] Cs199 [1 12]
Cs2 [1 12] Cs200 [1 12] Cs21 [1 12] Cs211 [1 12]
Cs212 [1 12] Cs214 [1 12] Cs215 [1 12] Cs216 [1 12]
Cs217 [1 12] Cs218 [1 12] Cs219 [1 12] Cs22 [1 12]
Cs220 [1 12] Cs221 [1 12] Cs222 [1 12] Cs223 [1 12]
Cs224 [1 12] Cs226 [1 12] Cs227 [1 12] Cs228 [1 12]
Cs229 [1 12] Cs23 [1 12] Cs230 [1 12] Cs232 [1 12]
Cs233 [1 12] Cs234 [1 12] Cs238 [1 12] Cs239 [1 12]
Cs240 [1 12] Cs241 [1 12] Cs3 [1 12] Cs30 [1 12]
Cs31 [1 12] Cs32 [1 12] Cs33 [1 12] Cs34 [1 12]
Cs35 [1 12] Cs36 [1 12] Cs37 [1 12] Cs38 [1 12]
Cs42 [1 12] Cs43 [1 12] Cs44 [1 12] Cs45 [1 12]
Cs47 [1 12] Cs48 [1 12] Cs49 [1 12] Cs5 [1 12]
Cs5-6 [1 2] Cs50 [1 12] Cs51 [1 12] Cs52 [1 12]
Cs53 [1 12] Cs55 [1 12] Cs56 [1 12] Cs57 [1 12]
Cs58 [1 12] Cs59 [1 12] Cs6 [1 12] Cs6-4 [1 2]
Cs60 [1 12] Cs61 [1 12] Cs62 [1 12] Cs63 [1 12]
Cs64 [1 12] Cs66 [1 12] Cs67 [1 12] Cs68 [1 12]
Cs69 [1 12] Cs7 [1 12] Cs70 [1 12] Cs72 [1 12]
Cs73 [1 12] Cs75 [1 12] Cs76 [1 12] Cs77 [1 12]
Cs78 [1 12] Cs8 [1 12] Cs8-4 [1] Cs81 [1 12]
Cs82 [1 12] Cs83 [1 12] Cs84 [1 12] Cs85 [1 12]
Cs86 [1 12] Cs87 [1 12] Cs88 [1 12] Cs89 [1 12]
Cs9 [1 12] Cs9-1 [1] Cs91 [1 12] Cs93 [1 12]
Cs96 [1 12] Cs98 [1 12] Cs99 [1 12] CsAUPk01-23 [1 1]
CsAUPk01-26 [1 1] CsAUPk01-27 [1 1] CsAUPk01-28 [1 1] CsAUPk01-29 [1 1]
CsAUPk01-30 [1 1] CsAUPk01-31 [1 1] CsAUPk01-32 [1 1] CsBAHb01-06 [1 1]
CsBAHb02-41 [1 1] CsBAHb02-43 [1 1] CsBAHb02-44 [1 1] CsBAHb02-48 [1 1]
CsBAHb02-51 [1 1] CsBAHb02-52 [1 1] CsBAHb03-22 [1 1] CsBAHb03-24 [1 1]
CsBAHb03-25 [1 1] CsBAHb03-26 [1 1] CsBAHb03-31 [1 1] CsBAHb03-32 [1 1]
CsBX [2 2] CsCC [2 2] CsDG [2 2] CsHL [2 2]
CsMUPk01_21 [1 1 1] CsMUPk03-26 [1 1] CsMUPk03-33 [1 1] CsMUPk03-34 [1 1]
CsMUPk03-41 [1 1] CsMUPk03-42 [1 1] CsSC [2 2] CsSH [2 2]
CsTJ [2 2] CsTL [2 2] Csd1 [1] Csd2 [1]
Csd3-1 [1] Csd3-2 [1] Csd5 [1] Csd6 [1]
Csh [1] DaQing [1] E102_NB [1] E119_NB [1]
E59_NB [1] ETX1_NB [1] Eggs in cat faeces1 [1] GL [1]
GR1 [2 2] GR2 [1 1] Goryeong [1] Goryeong mummy [1 1]
H1 [1] H1caa [1 1] H1kaa [1 1] HJB [3 3 3]
HJD [4 4 4] HJE [2 2 2] HJF [1 1 1] HXCS-h66 [1]
HXCS-h77 [1] HZG1 [1] HZG2 [1] HZG3 [1]
HaiLun [1] HbHb01-21 [2 2 1] K.10 [1 1 1] K.14 [1 1 1]
K.16 [1 1 1] K.19 [1 1 1] K.2 [1 1 1] K.6 [1 1 1]
K.7 [1 1 1] KOJp01-21 [2 2 1] Kolkata ERS [1] Korea [3]
MC1 [2] MC2 [1] Mungyeong1 [2 1] NB1 [1 1]
NB11 [1 1] NB12 [1 1] NNCS [3] Nghe An [1 1]
Ninh Binh [1 1] P.12 [1 1 1] P.13 [1 1 1] P.18 [1 1 1]
P.9 [1 1 1] PT1 [1 1] PT2 [1 1] PT3 [1 1]
PT4 [1 1] PT5 [1 1] Q-CS1-YB [1 1] Q-CS10-YB [1 1]
Q-CS2-YB [1 1] Q-CS3-YB [1 1] Q-CS4-YB [1 1] Q-CS5-YB [1 1]
Q-CS6-YB [1 1] Q-CS7-YB [1 1] Q-CS8-YB [1 1] Q-CS9-YB [1 1]
Shenyang [2] ShuangCheng [1] SuiHua [1] TaiLai [1]
Thanh Hoa [1 1] TongJing [1] YB1 [1 1] case1 [1]
case2 [1] case3 [1] henan [1 1] ldm1 [1]
ldm3 [1]
nat-host
Homo sapiens [1] Pseudorasbora parva [1]
specimen-voucher
E102 [1] E119 [1] E59 [1] E_TX1 [1]
F16YB_Parapleurolophocercous [1] YB19P17 [1] YB19P20 [1] YB19P3 [1]


Disclaimer: The NCBI taxonomy database is not an authoritative source for nomenclature or classification - please consult the relevant scientific literature for the most reliable information.

Reference: How to cite this resource - Schoch CL, et al. NCBI Taxonomy: a comprehensive update on curation, resources and tools. Database (Oxford). 2020: baaa062. PubMed: 32761142 PMC: PMC7408187.


Comments and questions to info@ncbi.nlm.nih.gov

[Help] [Search] [NLM NIH] [Disclaimer]