Conserved Protein Domain Family
matK

?
CHL00002: matK 
maturase K
Statistics
?
PSSM-Id: 214331
Aligned: 109 rows
Threshold Bit Score: 547.58
Created: 9-Dec-2010
Updated: 25-Oct-2021
Structure
?
Aligned Rows:
Sequence Alignment
?
Format: Row Display: Color Bits: Type Selection:
292559492   1 MEELQGYLEKDRSRQQHFLYPLLFKEYIYTFVHDRGLn---SSVFYESTeifGY--DNKSSSVLVKRSIIRMYQQNYLI- 74 
222084074   1 MDEFHRYGKEDSSWQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLd---GSSSSESMe--HFssNDQFSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
237688444   1 MDEFHRYGKEDSSWQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLdgssSSEPMEHL---SS--NDQFSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
7524595     1 MDEFHRCGKEDSFWQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLdvssSSRPMEHL---SS--NDQLSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
237688645   1 MDEFHRYGKEDNSRQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLdgssSSEPMEHL---SS--NDQFSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
237688577   1 MDEFHRYGKEDNSRQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLd---GSSYSEPMehlSS--NDQFSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
29565586    1 MDEFHRYGKEDNSRQQCFLYPLFFQEDLYAISHDHYLdgssSSEPMEHL---SS--NDQFSFLTVKRLIGQIRQQNHSI- 74 
172072912   1 MGEFQRNENKHKSWQQFFLYPLFFREDLYAIAHDHHLd---RSGSSEPT---EIlvSNFLSFLTVKRSIRRMRKQTNSI- 73 
161622291   1 MEEFKVYFEKDGSRQQYFLYPLLFQEYIYALAHNHVLn---GLIFYESSenfVY--DNKFSLIIVKRLITQMYQQNSLS- 74 
150251437   1 MDKFRRNGKEDTFRQRRFLYPLLFQENLYAIAYDHYLs---RSSSFESMensSY--NDRFSFLTVKRLISRIRQQNGSIv 75 
292559492  75 -YSVNDSNQNRFVGHNNYFYfhfySQMILEGFAVIVEIPFLLRLVSS--LEEKKIPKSQnlNLRSIHSTFPFLEDKLSHL 151
222084074  75 -VLFLNCDSNPLVDRNKSSY----SESVLEGLTLVLEVPFSIRSKYS--V--EGMNEWK--SFRSIHSIFPFLEEKFPHS 143
237688444  75 -VLFVNCDPNPLVDRKKSSY----SESVLEGLTLVLEVPFSIRSKYS--V--EGMNEWK--SFRSIHSIFPFLEDKFPHS 143
7524595    75 -VLFVNCDPNPLADRKKSFY----SESVLEALTLVLEVPFSIWSKSS--V--EGMNECK--SFRSIHSIFPFLEDKFPHS 143
237688645  75 -VLFVNCAPNPLADCKKSSY----SESVLEGLTLVLEVPFSIRSKYS--V--EGMNEWK--SFRSIHSIFPFLEDKFPHS 143
237688577  75 -VLFVNCAPNPLADCKKSSY----SESVLEGLTLVLEVPFSIRSKYS--V--EGMNEWK--SFRSIHSIFPFLEEKFPHS 143
29565586   75 -VLFVNCAPNPLADCKKSSY----SESVLEGLTLVLEVPFSIRSKYS--V--EGMNEWK--SFRSIHSIFPFLEDKFPHS 143
172072912  74 -SLFGNSDPNKLIECNKNFY----SKSILEGFTIVLEVSFAMRSKHF--I--EGMNGWN--SLRSIHCLFPLMEDKLPHS 142
161622291  75 -NLVNDSNRNRLVRQNKNFY----YQTILEGFSVIMEIPFSIIFLSSveEKKAKIPKIQ--NLRSIHATFPFLEDKLSHL 147
150251437  76 sFGNYNQNKNKLVGHNRNFY----SELVLEGLTVVLEVTFSIQSKHY--L--EGMNEWN--SFRSIHSIFPFMEDKFPHS 145
292559492 152 NYVSDILIPYPIHLKILVQILQFWIQDVPSLHLLRFFLHEYHNWNSLIT---PNNSIFLFSKENKRVFR-FPYNSYVSEC 227
222084074 144 NYILDTRIPYSIHPEILVRTFRRWIRDAPSLHPLRSVLYKYR--NSPEN---FKRSIIVAPRVNTRFLL-FLWNHYVYEC 217
237688444 144 NYVSDTRIPYSIHPEILVRTFRRWIGDAPSLHPLRSILYEYRNSSESLQ-----RSIIVVPKVNTRFFL-FLWNNYVYEC 217
7524595   144 NSILDARIPYSIHPEILVRTFRRWIRDAPSLHPLRSVLYDYRNSPENLQ-----RSIIVVPRVNTRFFL-FLLNYYVCEC 217
237688645 144 NYISDARIPYFIHPEILVRTFRRWIRDAPSLHPLRSVLYEYRNSPENLQ-----RSIIVVPRVNTRFFL-FLWNYYVYEC 217
237688577 144 NYISDARIPYSIHPEILVRTFRRWIRDAPSLHPLRSVLYEYRNSPENLQ-----RSIIVVPRVNTRFFL-FLWNYYVYEC 217
29565586  144 NYISDARIPYSIHPEILVRTFRRLIRDAPSLHPLRSVLYEYRNSPENLQ-----RSIIVVPRVNTRFFL-FLWNYYVYEC 217
172072912 143 NYISDIRVPYSIHPEILVRIFRRWIRDAPSLHLLRSILH---EWKNSFSrenLQKALITQ-IENTRFSL-FLWNSYVYEC 217
161622291 148 NHVSDILIPYPIHLEILVQVLQGWIQDVPSLHLLRFFLHEFHNWNSLITp--KKSISFLFSKGNQRLFL-FLYNSYVFEC 224
150251437 146 NFLLDIRIPHSTHPEILVRTFRYWIQDAPSLHSLRSVLHEHR---NLILsenLDQLILIASKEKTRLSLsVLWNYYVYEC 222
292559492 228 EFVLVFLRKQSSYLRLTSSGAFLERTHFYGKIEHRIVVR--R--NYFQKTLWFFKDPFMHYVRYQGKAILVSKGTHLLMK 303
222084074 218 ESILVPLLKQSFHPRSSSHGSFPERTHFDRKIKNIIRIS--R--RNSLKSIWSLKDPRIHYVRYGERSIIAIKGTHLLVK 293
237688444 218 ESILVSLLKRSSHSRSLSHGSFPQRTHFHRKIKNIFLFS--R--RNSLQSIWSLKDPNIHYVRYGERSIIAIKGTHLLVK 293
7524595   218 ESILFSRLKRSSHSRSLSHGSFPQRTHFHRKIKHIIIFS--R--RNSLKSIWSLKDPKIHYVRYGERPIIAIKGADLLVK 293
237688645 218 ESIFFSLLKRSSHSRSLSHRPFPQRTHFHRKIKHIIIFS--R--RNSLKSIWLLKDPKIHYVRYGERSIIAIKGTHLLVK 293
237688577 218 ESIFFSLLKRSSHSRSLSHRPFPQRTHFHRKIKHIIIFS--R--RNSLKSIWLLKDPKIHYVRYGERSIIAIKGTHLLVK 293
29565586  218 ESILFSLLKRSSHSRSLSHRPFPQRTHFHRKIKHIIIFS--R--RNSLKSIWLLKDPKINYVRYGERSIIAIKGTHLLVK 293
172072912 218 ESFLIPLIKRFFNSQSLLYGSFPDRTHFDKKIKDIVLFP--R--KISTKKIWLLKDSFIHYVRYGERSLMALKGTHLQVK 293
161622291 225 ESALVFLRKQSFYLRSTSFGTFVERTHFYGKIEHIVVVR--R--KNFQKALSLFKDPFIHYIRYKGKSILASKGTHFLMK 300
150251437 223 ESLLVPLWKRFSYSRSLSYGAFLERTTFYRKIEHIV-IFshKsiKDLKKRIWFLKDPSIHYVKDRERFLIALRGTYLLVK 301
292559492 304 KWKCYLVNFWQYYFHFWSQPYRIHINQLSNCSFYFLGYLSSVLINPSAVRNQMLENSFLIDTVIKKFDTRVPVITLIGSL 383
222084074 294 KCRYHLLIFWQCYFHLWSEPYRVCSHQLSKNCSSFLGYFLRVRMKSLLVRTKMLDELFITDLITDEFYPIVPIVPIIGLL 373
237688444 294 KYRYYLPIFRQCYFHLWNEPYRVCSHQLSKNCSSSLGYFMRVRMKPLLVKTKMLDELFIADLITDEFDPIVPIVPIIGLL 373
7524595   294 KCRYYLLIFRQFYFHLWSEPYRVCSHQLSKNCSSSPGYFLRVRMNPLLVRTKTLDELFIPVLITNEMDPIVPIVPIIGLL 373
237688645 294 KCRYYLLLFRQCYFHLWSEPYRVCSHQLSKNCSSSLGYFLRVRMNPLLVRTKMLDELFIADLITNEFDPIVPIVPILGLL 373
237688577 294 KCRYYLLLFRQCYFHLWSEPYRVCSHQLSKNCSSSLGYFLRVRMNPLLVRTKMLDELFIADLITNEFDPIVPIVPILGLL 373
29565586  294 KCRYYLLLFRQCYFHLWSEPYRVCSHQLSKNCSSSPGYFLRVRMNPLFVRTKMLDELFIADLITNEFDPIVPIVPILGLL 373
172072912 294 KCRYHLFHFWQYYFHLWFQPYRICSLQLSKTSFSFLGYFLHVKMKPLVVRVKMLDDLFITDLITNELNPIAPIRAILFFL 373
161622291 301 KWKYHLLNFWQCHFDFWSQPHRIHINQLSNHSFYFMGYLSSVRINFSTVRSQMLESSFLMDTPTKKFDTIVPIIPLIGSL 380
150251437 302 KWRYHLTNFWQCHFHLRSQPYRMSIDELSKNCFSFLGYLFSVQMKTFVVKIKMLDDSFITDPITKEFDPIAPTTLLIGYL 381
292559492 384 SKAKFCTVLGHPISKPIWTDLSDCDIIDRFGRICRNLSHYHSGSSKKQSLYRIKYILRFSCARTLARKHKSTVRAFLQRL 463
222084074 374 AREKFCDISGRPISKLYWTSLTDDDILDRFDRIWKNLFHYYSGSFGRDGLYRIKYILSLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
237688444 374 SREKFCDISGRPISKLSWTSLTDDDILDRFDRIWRNLFHYYSGSFGRDGLYRIKYILSLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
7524595   374 ATEKFCDISGRPISKLSWTSLTDDDILDRFDQIWRNLFHYYSGSFDRDGLYRIKYILLLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
237688645 374 AREKFCDISGRPISKLSWTNLTDDDILNRFDQIWRNLFHYYSGSFGRDGLYRIKYILSLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
237688577 374 AREKFCDISGRPISKLSWTNLTDDDILNRFDQIWRNLFHYYSGSFGRDGLYRIKYILSLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
29565586  374 AREKFCDVSGRPISKLSWTNLTDDDILNRFDQIWRNLFHYYSGSFGRDGLYRIKYILSLSCAKTLACKHKSTIRVVRKEL 453
172072912 374 AKEKFCDISGWPISKLSWTSLSDDDILDRFDRIWINLFHYYSGSINQEGLYHIKYILLLSCAKTLACKHKSTIRVVREQL 453
161622291 381 AKAKFCNVSGHPVSKPVWADLSDADIIDRFGRICRNLSHYHSGSSKKQSLYRVKYILRLSCARTLARKHKSTVRAFFKRL 460
150251437 382 AKERFCDISGRPTGRLAWTGLTDDNILHRFDRIWRNILHYYSGSSKKDGLYRMKYILRLPCAKTLACKHKSAIRVVRERF 461
292559492 464 GSGLLEEFFMKEEQVVSLIFPKTTSFSLH--ESHIeRIWYLDIIHINDLVNYS 514
222084074 454 GPELFKKSFSKEREFDFPAF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLANSW 501
237688444 454 GPELFKKSFSKERELDSPPF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLAHSW 501
7524595   454 GPELFKKSFSKEREFDSLPF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLANSW 501
237688645 454 GPELFQKSFSKEREFDSLPF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLANSW 501
237688577 454 GPELFQKSFSKEREFDSLPF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLANSW 501
29565586  454 GPELFQKSFSKEREFDSLPF--SSKAAAR--SQRE-RIWHSDIPQINPLVNSW 501
172072912 454 GSELFTKSF-SKEKFISSSF-------SKtrSQRE-RIWNSEISQINPLANFW 497
161622291 461 GSEFLEEFFTDKEQVLSLIFPSLRSPSHR--VHKGeRIWYLDIIRINDLVNNS 511
150251437 462 GSELFTKSSPKERELISLSF-------SKtrSQRE-RIWHSDILQRNPFVNSW 506
| Disclaimer | Privacy statement | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap