NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Platform GPL11410 Query DataSets for GPL11410
Status Public on Jan 10, 2011
Title [MoEx-1_0-st] Affymetrix Mouse Exon 1.0 ST Array (MoEx-1_0-st-v1.na25.mm9.core+miRNA.SH.11023.mps)
Technology type in situ oligonucleotide
Distribution custom-commercial
Organism Mus musculus
Manufacturer Affymetrix
Manufacture protocol see manufacturer's website
 
 
Submission date Jan 10, 2011
Last update date Jan 10, 2011
Contact name GEO admin
E-mail(s) geo@ncbi.nlm.nih.gov
Organization name NCBI/NLM/NIH
Street address 9000 Rockville Pike
City Bethesda
State/province MD
ZIP/Postal code 20892
Country USA
 
Samples (6) GSM651921, GSM651922, GSM651923, GSM651924, GSM651925, GSM651926
Series (1)
GSE25310 Genome-wide identification of Ago2 binding sites from mouse embryonic stem cells with and without mature microRNAs
Relations
Alternative to GPL6096 (official)

Data table header descriptions
ID transcript_cluster_id LINK_PRE:https://www.affymetrix.com/LinkServlet?array=MoEx-1_0-st-v1&probeset=
GB_LIST GenBank and RefSeq Accessions from mrna_assignment column LINK_PRE:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=nucleotide&cmd=search&term= DELIMIT:,
SPOT_ID genomic location of the transcript cluster in the version of the genome assembly used at annotation time. Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
seqname chromosome number
RANGE_GB NCBI RefSeq for chromosome of current build
RANGE_STRAND strand (+|-)
RANGE_START start (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
RANGE_STOP stop (integer). Coordinates are standard 1-based (length=stop-start+1).
total_probes Total number of probes contained by this transcript cluster
gene_assignment Gene information for each assigned mRNA for mRNAs that corresponds to known genes
mrna_assignment Description of the public mRNAs that should be detected by the sets within this transcript cluster based on sequence alignment
category Array design category of the transcript cluster

Data table
ID GB_LIST SPOT_ID seqname RANGE_GB RANGE_STRAND RANGE_START RANGE_STOP total_probes gene_assignment mrna_assignment category
6823768 NM_172254,NM_001047433,BC039954 chr14:32873899-32898895 chr14 NC_000080.5 - 32873899 32898895 78 NM_172254 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// NM_001047433 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// BC039954 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// ENSMUST00000067955 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// ENSMUST00000112001 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// ENSMUST00000022461 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 /// ENSMUST00000112000 // Dph3 // DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) // 14 B // 105638 NM_172254 // RefSeq // Mus musculus DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) (Dph3), transcript variant 1, mRNA. // chr14 // 100 // 33 // 26 // 26 // 0 /// NM_001047433 // RefSeq // Mus musculus DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae) (Dph3), transcript variant 2, mRNA. // chr14 // 100 // 28 // 22 // 22 // 0 /// BC039954 // GenBank // Mus musculus DPH3 homolog (KTI11, S. cerevisiae), mRNA (cDNA clone MGC:49505 IMAGE:4193739), complete cds. // chr14 // 100 // 26 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000067955 // ENSEMBL // DPH3 homolog gene:ENSMUSG00000021905 // chr14 // 100 // 33 // 26 // 26 // 0 /// ENSMUST00000112001 // ENSEMBL // zinc finger, CSL domain containing 2 isoform 2 gene:ENSMUSG00000021905 // chr14 // 100 // 28 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000022461 // ENSEMBL // DPH3 homolog gene:ENSMUSG00000021905 // chr14 // 100 // 26 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000112000 // ENSEMBL // 8 kDa protein gene:ENSMUSG00000021905 // chr14 // 100 // 21 // 16 // 16 // 0 main
6933677 NM_007475,BC087887 chr5:116007360-116013726 chr5 NC_000071.5 + 116007360 116013726 85 NM_007475 // Rplp0 // ribosomal protein, large, P0 // 5 F // 11837 /// BC087887 // Rplp0 // ribosomal protein, large, P0 // 5 F // 11837 /// ENSMUST00000086519 // Rplp0 // ribosomal protein, large, P0 // 5 F // 11837 /// ENSMUST00000086519 // Rplp0 // ribosomal protein, large, P0 // 5 F // 11837 NM_007475 // RefSeq // Mus musculus ribosomal protein, large, P0 (Rplp0), mRNA. // chr5 // 100 // 58 // 49 // 49 // 0 /// BC087887 // GenBank // Mus musculus ribosomal protein, large, P0, mRNA (cDNA clone MGC:107165 IMAGE:6594755), complete cds. // chr5 // 100 // 48 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000086519 // ENSEMBL // 60S acidic ribosomal protein P0 gene:ENSMUSG00000067274 // chr5 // 100 // 48 // 41 // 41 // 0 /// GENSCAN00000015149 // ENSEMBL // cdna:Genscan chromosome:NCBIM37:2:152179351:152182328:1 // chr5 // 38 // 9 // 3 // 8 // 1 main
6958212 NM_177222,AY485607 chr6:145123364-145159536 chr6 NC_000072.5 - 145123364 145159536 146 NM_177222 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 /// AY485607 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 /// ENSMUST00000111727 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 /// ENSMUST00000060797 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 /// ENSMUST00000057366 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 /// ENSMUST00000111728 // Casc1 // cancer susceptibility candidate 1 // 6 G3|6 71.1 cM // 320662 NM_177222 // RefSeq // Mus musculus cancer susceptibility candidate 1 (Casc1), mRNA. // chr6 // 95 // 50 // 69 // 73 // 0 /// AY485607 // GenBank // Mus musculus strain A/J lung adenoma susceptibility 1 (Casc1) mRNA, complete cds. // chr6 // 93 // 51 // 70 // 75 // 0 /// ENSMUST00000111727 // ENSEMBL // 79 kDa protein gene:ENSMUSG00000043541 // chr6 // 100 // 58 // 84 // 84 // 0 /// ENSMUST00000060797 // ENSEMBL // Isoform 1 of Cancer susceptibility candidate protein 1 gene:ENSMUSG00000043541 // chr6 // 100 // 51 // 75 // 75 // 0 /// ENSMUST00000057366 // ENSEMBL // Isoform 2 of Cancer susceptibility candidate protein 1 gene:ENSMUSG00000043541 // chr6 // 100 // 49 // 71 // 71 // 0 /// ENSMUST00000111728 // ENSEMBL // Isoform 2 of Cancer susceptibility candidate protein 1 gene:ENSMUSG00000043541 // chr6 // 100 // 47 // 68 // 68 // 0 main
6933678 NM_172719,BC150735 chr5:116015066-116072822 chr5 NC_000071.5 + 116015066 116072822 406 NM_172719 // Gcn1l1 // GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) // 5 F // 231659 /// BC150735 // Gcn1l1 // GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) // 5 F // 231659 /// ENSMUST00000064454 // Gcn1l1 // GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) // 5 F // 231659 /// ENSMUST00000094427 // Gcn1l1 // GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) // 5 F // 231659 NM_172719 // RefSeq // Mus musculus GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast) (Gcn1l1), mRNA. // chr5 // 100 // 64 // 259 // 259 // 0 /// BC150735 // GenBank // Mus musculus GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:183646 IMAGE:9087646), complete cds. // chr5 // 93 // 63 // 237 // 255 // 0 /// ENSMUST00000064454 // ENSEMBL // GCN1 general control of amino-acid synthesis 1-like 1 gene:ENSMUSG00000041638 // chr5 // 100 // 64 // 259 // 259 // 0 /// ENSMUST00000094427 // ENSEMBL // Putative uncharacterized protein gene:ENSMUSG00000041638 // chr5 // 100 // 25 // 102 // 102 // 0 main
6933679 NM_198163,BC056466 chr5:116081958-116097735 chr5 NC_000071.5 + 116081958 116097735 38 NM_198163 // Rab35 // RAB35, member RAS oncogene family // 5 F // 77407 /// BC056466 // Rab35 // RAB35, member RAS oncogene family // 5 F // 77407 /// ENSMUST00000031492 // Rab35 // RAB35, member RAS oncogene family // 5 F // 77407 NM_198163 // RefSeq // Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family (Rab35), mRNA. // chr5 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// BC056466 // GenBank // Mus musculus RAB35, member RAS oncogene family, mRNA (cDNA clone MGC:67236 IMAGE:5717246), complete cds. // chr5 // 100 // 76 // 29 // 29 // 0 /// ENSMUST00000031492 // ENSEMBL // Ras-related protein Rab-35 gene:ENSMUSG00000029518 // chr5 // 100 // 74 // 28 // 28 // 0 main
6983639 NM_020259,AF116865 chr8:82463001-82598408 chr8 NC_000074.5 - 82463001 82598408 203 NM_020259 // Hhip // Hedgehog-interacting protein // 8 C3|8 40.0 cM // 15245 /// AF116865 // Hhip // Hedgehog-interacting protein // 8 C3|8 40.0 cM // 15245 /// ENSMUST00000079038 // Hhip // Hedgehog-interacting protein // 8 C3|8 40.0 cM // 15245 NM_020259 // RefSeq // Mus musculus Hedgehog-interacting protein (Hhip), mRNA. // chr8 // 100 // 39 // 80 // 80 // 0 /// AF116865 // GenBank // Mus musculus hedgehog-interacting protein (Hip) mRNA, complete cds. // chr8 // 96 // 34 // 66 // 69 // 0 /// ENSMUST00000079038 // ENSEMBL // Hedgehog-interacting protein gene:ENSMUSG00000064325 // chr8 // 100 // 35 // 71 // 71 // 0 main
6958216 NM_021284,BC141051 chr6:145165223-145198739 chr6 NC_000072.5 - 145165223 145198739 112 NM_021284 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 /// BC141051 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 /// ENSMUST00000032399 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 /// ENSMUST00000111710 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 /// ENSMUST00000111709 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 /// ENSMUST00000032397 // Kras // v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog // 6 G2|6 71.2 cM // 16653 NM_021284 // RefSeq // Mus musculus v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog (Kras), mRNA. // chr6 // 100 // 23 // 27 // 26 // 0 /// BC141051 // GenBank // Mus musculus v-Ki-ras2 Kirsten rat sarcoma viral oncogene homolog, mRNA (cDNA clone MGC:176012 IMAGE:9055663), complete cds. // chr6 // 100 // 19 // 21 // 21 // 0 /// ENSMUST00000032399 // ENSEMBL // Isoform 2B of GTPase KRas gene:ENSMUSG00000030265 // chr6 // 100 // 23 // 28 // 26 // 0 /// ENSMUST00000111710 // ENSEMBL // Isoform 2A of GTPase KRas gene:ENSMUSG00000030265 // chr6 // 100 // 20 // 23 // 22 // 0 /// ENSMUST00000111709 // ENSEMBL // Ras gene:ENSMUSG00000030265 // chr6 // 100 // 18 // 20 // 20 // 0 /// ENSMUST00000032397 // ENSEMBL // Isoform 2A of GTPase KRas gene:ENSMUSG00000030265 // chr6 // 100 // 16 // 20 // 18 // 0 main
6823780 NM_016897,BC096669 chr14:32993352-33015102 chr14 NC_000080.5 - 32993352 33015102 74 NM_016897 // Timm23 // translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) // 14 B // 53600 /// BC096669 // Timm23 // translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) // 14 B // 53600 /// ENSMUST00000013845 // ENSMUSG00000069622 // predicted gene, ENSMUSG00000069622 // 10 B4 // 100039174 /// ENSMUST00000013845 // ENSMUSG00000066693 // predicted gene, ENSMUSG00000066693 // 1 H3 // 100041219 /// ENSMUST00000013845 // ENSMUSG00000068165 // predicted gene, ENSMUSG00000068165 // 14 D1 // 100043675 /// ENSMUST00000013845 // Timm23 // translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) // 14 B // 53600 /// ENSMUST00000092511 // ENSMUSG00000069622 // predicted gene, ENSMUSG00000069622 // 10 B4 // 100039174 /// ENSMUST00000092511 // ENSMUSG00000066693 // predicted gene, ENSMUSG00000066693 // 1 H3 // 100041219 /// ENSMUST00000092511 // ENSMUSG00000068165 // predicted gene, ENSMUSG00000068165 // 14 D1 // 100043675 /// ENSMUST00000092511 // Timm23 // translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) // 14 B // 53600 NM_016897 // RefSeq // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast) (Timm23), nuclear gene encoding mitochondrial protein, mRNA. // chr14 // 100 // 42 // 31 // 31 // 0 /// BC096669 // GenBank // Mus musculus translocase of inner mitochondrial membrane 23 homolog (yeast), mRNA (cDNA clone MGC:106986 IMAGE:5056242), complete cds. // chr14 // 100 // 46 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000013845 // ENSEMBL // MCG125709 gene:ENSMUSG00000013701 // chr14 // 100 // 46 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000092511 // ENSEMBL // MCG125709 gene:ENSMUSG00000069622 // chr14 // 100 // 46 // 34 // 34 // 0 main
6848316 NM_001114339,NM_023792,AF347700 chr16:7306501-90893442 chr16 NC_000082.5 + 7306501 90893442 75 NM_001114339 // Pank1 // pantothenate kinase 1 // --- // 75735 /// NM_023792 // Pank1 // pantothenate kinase 1 // --- // 75735 /// AF347700 // Pank1 // pantothenate kinase 1 // --- // 75735 /// ENSMUST00000036584 // Pank1 // pantothenate kinase 1 // --- // 75735 /// ENSMUST00000112460 // Pank1 // pantothenate kinase 1 // --- // 75735 NM_001114339 // RefSeq // Mus musculus pantothenate kinase 1 (Pank1), transcript variant 1, mRNA. // chr19 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// NM_023792 // RefSeq // Mus musculus pantothenate kinase 1 (Pank1), transcript variant 2, mRNA. // chr19 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// AF347700 // GenBank // Mus musculus pantothenate kinase 1 alpha (Pank1) mRNA, complete cds. // chr19 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// mmu-mir-107 // miRBase Micro RNA Database // MI0000684 Mus musculus miR-107 stem-loop // chr19 // 100 // 5 // 4 // 4 // 0 /// mmu-mir-107 // miRBase Micro RNA Database // MI0000684 Mus musculus miR-107 stem-loop // chr19 // 100 // 5 // 4 // 4 // 0 /// ENSMUST00000036584 // ENSEMBL // Isoform 1 of Pantothenate kinase 1 gene:ENSMUSG00000033610 // chr19 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 /// ENSMUST00000112460 // ENSEMBL // Isoform 2 of Pantothenate kinase 1 gene:ENSMUSG00000033610 // chr19 // 100 // 16 // 12 // 12 // 0 main
6873744 NM_133216,BC065174 chr19:53005806-53113768 chr19 NC_000085.5 - 53005806 53113768 261 NM_133216 // Xpnpep1 // X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble // 19 D2 // 170750 /// BC065174 // Xpnpep1 // X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble // 19 D2 // 170750 /// ENSMUST00000069988 // Xpnpep1 // X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble // 19 D2 // 170750 /// ENSMUST00000111747 // Xpnpep1 // X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble // 19 D2 // 170750 NM_133216 // RefSeq // Mus musculus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble (Xpnpep1), mRNA. // chr19 // 100 // 33 // 86 // 86 // 0 /// BC065174 // GenBank // Mus musculus X-prolyl aminopeptidase (aminopeptidase P) 1, soluble, mRNA (cDNA clone MGC:90061 IMAGE:6415314), complete cds. // chr19 // 100 // 33 // 86 // 86 // 0 /// ENSMUST00000069988 // ENSEMBL // Xaa-Pro aminopeptidase 1 gene:ENSMUSG00000025027 // chr19 // 100 // 33 // 86 // 86 // 0 /// ENSMUST00000111747 // ENSEMBL // X-prolyl aminopeptidase (Aminopeptidase P) 1, soluble, isoform CRA_b gene:ENSMUSG00000025027 // chr19 // 100 // 33 // 86 // 86 // 0 main
6763840 NM_175296,BC050800 chr1:168115771-168178081 chr1 NC_000067.5 - 168115771 168178081 99 NM_175296 // Mael // maelstrom homolog (Drosophila) // 1 H2.3 // 98558 /// BC050800 // Mael // maelstrom homolog (Drosophila) // 1 H2.3 // 98558 /// ENSMUST00000038782 // Mael // maelstrom homolog (Drosophila) // 1 H2.3 // 98558 NM_175296 // RefSeq // Mus musculus maelstrom homolog (Drosophila) (Mael), mRNA. // chr1 // 100 // 64 // 63 // 63 // 0 /// BC050800 // GenBank // Mus musculus maelstrom homolog (Drosophila), mRNA (cDNA clone MGC:58726 IMAGE:6744032), complete cds. // chr1 // 98 // 64 // 62 // 63 // 0 /// ENSMUST00000038782 // ENSEMBL // Protein maelstrom homolog gene:ENSMUSG00000040629 // chr1 // 100 // 61 // 60 // 60 // 0 main
6763841 AK030611 chr1:168236882-168239692 chr1 NC_000067.5 - 168236882 168239692 8 --- AK030611 // GenBank HTC // Mus musculus adult male pituitary gland cDNA, RIKEN full-length enriched library, clone:5330438I03 product:hypothetical protein, full insert sequence. // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 main
6933697 NM_007708,AF086824 chr5:116273374-116458936 chr5 NC_000071.5 + 116273374 116458936 468 NM_007708 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// AF086824 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000112014 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000102560 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000112008 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000051704 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000112011 // Cit // citron // 5 F // 12704 /// ENSMUST00000112006 // Cit // citron // 5 F // 12704 NM_007708 // RefSeq // Mus musculus citron (Cit), mRNA. // chr5 // 100 // 42 // 196 // 196 // 0 /// AF086824 // GenBank // Mus musculus rho/rac-interacting citron kinase (Crik) mRNA, complete cds. // chr5 // 96 // 41 // 186 // 194 // 0 /// ENSMUST00000112014 // ENSEMBL // Isoform 5 of Citron Rho-interacting kinase gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 43 // 203 // 203 // 0 /// ENSMUST00000102560 // ENSEMBL // Isoform 5 of Citron Rho-interacting kinase gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 43 // 203 // 203 // 0 /// ENSMUST00000112008 // ENSEMBL // 232 kDa protein gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 43 // 199 // 199 // 0 /// ENSMUST00000051704 // ENSEMBL // Isoform 1 of Citron Rho-interacting kinase gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 42 // 196 // 196 // 0 /// ENSMUST00000112011 // ENSEMBL // Isoform 4 of Citron Rho-interacting kinase gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 41 // 192 // 192 // 0 /// ENSMUST00000112006 // ENSEMBL // Isoform 3 of Citron Rho-interacting kinase gene:ENSMUSG00000029516 // chr5 // 100 // 31 // 144 // 144 // 0 main
6958232 NM_028742,BC053420 chr6:145313664-145542943 chr6 NC_000072.5 - 145313664 145542943 173 NM_028742 // Ifltd1 // intermediate filament tail domain containing 1 // 6 G3|6 71.3 cM // 74071 /// BC053420 // Ifltd1 // intermediate filament tail domain containing 1 // 6 G3|6 71.3 cM // 74071 /// ENSMUST00000111708 // Ifltd1 // intermediate filament tail domain containing 1 // 6 G3|6 71.3 cM // 74071 /// ENSMUST00000068290 // Ifltd1 // intermediate filament tail domain containing 1 // 6 G3|6 71.3 cM // 74071 /// ENSMUST00000111706 // Ifltd1 // intermediate filament tail domain containing 1 // 6 G3|6 71.3 cM // 74071 NM_028742 // RefSeq // Mus musculus intermediate filament tail domain containing 1 (Ifltd1), mRNA. // chr6 // 100 // 27 // 48 // 47 // 0 /// BC053420 // GenBank // Mus musculus intermediate filament tail domain containing 1, mRNA (cDNA clone MGC:58577 IMAGE:6705208), complete cds. // chr6 // 100 // 27 // 47 // 46 // 0 /// ENSMUST00000111708 // ENSEMBL // Intermediate filament tail domain-containing protein 1 gene:ENSMUSG00000054966 // chr6 // 100 // 27 // 48 // 47 // 0 /// ENSMUST00000068290 // ENSEMBL // Intermediate filament tail domain-containing protein 1 gene:ENSMUSG00000054966 // chr6 // 100 // 27 // 48 // 47 // 0 /// ENSMUST00000111706 // ENSEMBL // Putative uncharacterized protein gene:ENSMUSG00000054966 // chr6 // 100 // 24 // 41 // 41 // 0 main
6898276 NM_178726,BC096031 chr3:69113461-69364895 chr3 NC_000069.5 + 69113461 69364895 256 NM_178726 // Ppm1l // protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like // 3 E1 // 242083 /// BC096031 // Ppm1l // protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like // 3 E1 // 242083 /// ENSMUST00000029355 // Ppm1l // protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like // 3 E1 // 242083 /// ENSMUST00000068481 // Ppm1l // protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like // 3 E1 // 242083 NM_178726 // RefSeq // Mus musculus protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like (Ppm1l), mRNA. // chr3 // 100 // 21 // 53 // 53 // 0 /// BC096031 // GenBank // Mus musculus protein phosphatase 1 (formerly 2C)-like, mRNA (cDNA clone MGC:106606 IMAGE:6837066), complete cds. // chr3 // 100 // 21 // 53 // 53 // 0 /// ENSMUST00000029355 // ENSEMBL // Isoform 1 of Protein phosphatase 1L gene:ENSMUSG00000027784 // chr3 // 100 // 24 // 61 // 61 // 0 /// ENSMUST00000068481 // ENSEMBL // Isoform 2 of Protein phosphatase 1L gene:ENSMUSG00000027784 // chr3 // 100 // 13 // 32 // 32 // 0 main
6788368 NM_178626,BC048935 chr11:54513587-54606580 chr11 NC_000077.5 - 54513587 54606580 181 NM_178626 // Cdc42se2 // CDC42 small effector 2 // 11 B1.3 // 72729 /// BC048935 // Cdc42se2 // CDC42 small effector 2 // 11 B1.3 // 72729 /// ENSMUST00000064104 // Cdc42se2 // CDC42 small effector 2 // 11 B1.3 // 72729 NM_178626 // RefSeq // Mus musculus CDC42 small effector 2 (Cdc42se2), mRNA. // chr11 // 100 // 13 // 24 // 24 // 0 /// BC048935 // GenBank // Mus musculus CDC42 small effector 2, mRNA (cDNA clone MGC:56977 IMAGE:6394856), complete cds. // chr11 // 100 // 12 // 22 // 22 // 0 /// ENSMUST00000064104 // ENSEMBL // CDC42 small effector protein 2 gene:ENSMUSG00000052298 // chr11 // 100 // 13 // 24 // 24 // 0 main
6823797 NM_009891,BC119322 chr14:33221373-33279167 chr14 NC_000080.5 - 33221373 33279167 148 NM_009891 // Chat // choline acetyltransferase // 14 B|14 10.5 cM // 12647 /// BC119322 // Chat // choline acetyltransferase // 14 B|14 10.5 cM // 12647 /// ENSMUST00000070125 // Chat // choline acetyltransferase // 14 B|14 10.5 cM // 12647 NM_009891 // RefSeq // Mus musculus choline acetyltransferase (Chat), mRNA. // chr14 // 100 // 57 // 84 // 84 // 0 /// BC119322 // GenBank // Mus musculus choline acetyltransferase, mRNA (cDNA clone MGC:155638 IMAGE:8734071), complete cds. // chr14 // 100 // 51 // 76 // 76 // 0 /// ENSMUST00000070125 // ENSEMBL // Putative uncharacterized protein gene:ENSMUSG00000021919 // chr14 // 100 // 57 // 84 // 84 // 0 main
6823798 NM_021712,BC120498 chr14:33275634-33278724 chr14 NC_000080.5 - 33275634 33278724 12 NM_021712 // Slc18a3 // solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 3 // 14 B|14 10.5 cM // 20508 /// BC120498 // Slc18a3 // solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 3 // 14 B|14 10.5 cM // 20508 NM_021712 // RefSeq // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 3 (Slc18a3), mRNA. // chr14 // 100 // 75 // 9 // 9 // 0 /// BC120498 // GenBank // Mus musculus solute carrier family 18 (vesicular monoamine), member 3, mRNA (cDNA clone MGC:155735 IMAGE:40129421), complete cds. // chr14 // 100 // 33 // 4 // 4 // 0 main
6788375 NM_029327,BC139406 chr11:54640370-54674418 chr11 NC_000077.5 - 54640370 54674418 82 NM_029327 // Lyrm7 // LYR motif containing 7 // 11 B1.3 // 75530 /// BC139406 // Lyrm7 // LYR motif containing 7 // 11 B1.3 // 75530 /// ENSMUST00000020506 // Lyrm7 // LYR motif containing 7 // 11 B1.3 // 75530 NM_029327 // RefSeq // Mus musculus LYR motif containing 7 (Lyrm7), mRNA. // chr11 // 100 // 29 // 24 // 24 // 0 /// BC139406 // GenBank // Mus musculus LYR motif containing 7, mRNA (cDNA clone IMAGE:8862428). // chr11 // 100 // 41 // 34 // 34 // 0 /// ENSMUST00000020506 // ENSEMBL // LYR motif-containing protein 7 gene:ENSMUSG00000020268 // chr11 // 100 // 49 // 40 // 40 // 0 main
6763853 NM_175170,BC072587 chr1:168314763-168391350 chr1 NC_000067.5 - 168314763 168391350 130 NM_175170 // Pogk // pogo transposable element with KRAB domain // 1 H2.3 // 71592 /// BC072587 // Pogk // pogo transposable element with KRAB domain // 1 H2.3 // 71592 /// ENSMUST00000111411 // Pogk // pogo transposable element with KRAB domain // 1 H2.3 // 71592 NM_175170 // RefSeq // Mus musculus pogo transposable element with KRAB domain (Pogk), mRNA. // chr1 // 100 // 49 // 64 // 64 // 0 /// BC072587 // GenBank // Mus musculus pogo transposable element with KRAB domain, mRNA (cDNA clone MGC:99912 IMAGE:6829796), complete cds. // chr1 // 100 // 32 // 41 // 41 // 0 /// ENSMUST00000111411 // ENSEMBL // pogo transposable element with KRAB domain gene:ENSMUSG00000040596 // chr1 // 100 // 38 // 49 // 49 // 0 main

Total number of rows: 17949

Table truncated, full table size 18424 Kbytes.




Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFTHelp
MINiML formatted family file(s) MINiMLHelp

Supplementary file Size Download File type/resource
GPL11410_MoEx-1_0-st-v1.na25.mm9.core+miRNA.SH.11023.mps.txt.gz 922.2 Kb (ftp)(http) TXT
GPL11410_MoEx-1_0-st-v1.na25.mm9.core+miRNA.SH.11023.ps.txt.gz 516.3 Kb (ftp)(http) TXT
GPL11410_README_arjunb9099.txt 490 b (ftp)(http) TXT

| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap