| Data table |
| ID |
probeset_id |
seqname |
strand |
start |
stop |
total_probes |
gene_assignment |
mrna_assignment |
category |
SPOT_ID |
| 13579638 |
13579638 |
chr1 |
+ |
395718 |
423275 |
9 |
ENSMMUT00000032498 // LRPAP1 // low density lipoprotein receptor-related protein associated protein 1 // --- // 699677 |
AB169484 // GenBank // Macaca fascicularis brain cDNA, clone: QccE-10192, similar to human low density lipoprotein receptor-related proteinassociated protein 1 (LRPAP1), mRNA, RefSeq: NM_002337.1. // chr1 // 50 // 50 // 5 // 10 // 0 /// AB172588 // GenBank // Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-18848, similar to human low density lipoprotein receptor-related proteinassociated protein 1 (LRPAP1), mRNA, RefSeq: NM_002337.1. // chr1 // 55 // 55 // 6 // 11 // 0 /// ENSMMUT00000032498 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:395718:423275:1 gene:ENSMMUG00000023099 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 3 // 6 // 0 |
main |
chr1(+):395718-423275 |
| 13579648 |
13579648 |
chr1 |
+ |
860499 |
860560 |
10 |
--- |
ENSMMUT00000052038 // ENSEMBL // ncrna:snRNA chromosome:MMUL_1:1:860499:860560:1 gene:ENSMMUG00000036304 gene_biotype:snRNA transcript_biotype:snRNA // chr1 // 100 // 100 // 10 // 10 // 0 |
main |
chr1(+):860499-860560 |
| 13579650 |
13579650 |
chr1 |
+ |
978606 |
1008388 |
14 |
XR_014348 // LOC720068 // nucleolar protein 14-like // --- // 720068 /// ENSMMUT00000011729 // NOP14 // --- // --- // --- |
XR_014348 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta nucleolar protein 14-like (LOC720068), miscRNA. // chr1 // 71 // 71 // 5 // 7 // 0 /// GENSCAN00000034094 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214708977:4148:21923:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 6 // 7 // 0 /// ENSMMUT00000011729 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:978606:1008388:1 gene:ENSMMUG00000008385 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 86 // 86 // 6 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):978606-1008388 |
| 13579671 |
13579671 |
chr1 |
+ |
1012238 |
1015066 |
11 |
XM_002808267 // LOC720098 // major facilitator superfamily domain-containing protein 10-like // --- // 720098 /// ENSMMUT00000011722 // LOC720098 // major facilitator superfamily domain-containing protein 10-like // --- // 720098 |
XM_002808267 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta major facilitator superfamily domain-containing protein 10-like (LOC720098), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 5 // 5 // 0 /// GENSCAN00000055688 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214615600:28:2854:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 4 // 8 // 0 /// ENSMMUT00000011722 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:1012238:1015066:1 gene:ENSMMUG00000008383 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 80 // 80 // 4 // 5 // 0 |
main |
chr1(+):1012238-1015066 |
| 13579680 |
13579680 |
chr1 |
+ |
1215117 |
1232469 |
7 |
XM_001118470 // LOC722308 // TNFAIP3-interacting protein 2-like // --- // 722308 |
XM_001118470 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta TNFAIP3-interacting protein 2-like (LOC722308), mRNA. // chr1 // 100 // 100 // 4 // 4 // 0 /// GENSCAN00000084121 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214720295:6062:24297:1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 83 // 83 // 5 // 6 // 0 |
main |
chr1(+):1215117-1232469 |
| 13579687 |
13579687 |
chr1 |
+ |
1363681 |
1363781 |
7 |
--- |
ENSMMUT00000034493 // ENSEMBL // ncrna:misc_RNA chromosome:MMUL_1:1:1363681:1363781:1 gene:ENSMMUG00000024792 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 |
main |
chr1(+):1363681-1363781 |
| 13579689 |
13579689 |
chr1 |
+ |
1633941 |
1646340 |
14 |
ENSMMUT00000001640 // LOC722333 // uncharacterized LOC722333 // --- // 722333 |
ENSMMUT00000001640 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:1633941:1646340:1 gene:ENSMMUG00000032306 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 61 // 61 // 14 // 23 // 0 |
main |
chr1(+):1633941-1646340 |
| 13579692 |
13579692 |
chr1 |
+ |
1662164 |
1681189 |
15 |
XM_001118499 // LOC722339 // uncharacterized LOC722339 // --- // 722339 /// ENSMMUT00000047703 // LOC722339 // uncharacterized LOC722339 // --- // 722339 |
XM_001118499 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta hypothetical LOC722339 (LOC722339), mRNA. // chr1 // 67 // 67 // 4 // 6 // 0 /// GENSCAN00000125255 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214689004:5859:11193:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 4 // 6 // 0 /// ENSMMUT00000047703 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:1662164:1681189:1 gene:ENSMMUG00000032305 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 13 // 23 // 0 |
main |
chr1(+):1662164-1681189 |
| 13579703 |
13579703 |
chr1 |
+ |
1688710 |
1703306 |
9 |
ENSMMUT00000001634 // LOC722345 // max dimerization protein 4-like // --- // 722345 /// ENSMMUT00000001636 // LOC722345 // max dimerization protein 4-like // --- // 722345 /// ENSMMUT00000001638 // LOC722345 // max dimerization protein 4-like // --- // 722345 |
ENSMMUT00000001634 // ENSEMBL // cdna:known_by_projection chromosome:MMUL_1:1:1688710:1701289:1 gene:ENSMMUG00000001160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 4 // 7 // 0 /// ENSMMUT00000001636 // ENSEMBL // cdna:known_by_projection chromosome:MMUL_1:1:1688794:1703306:1 gene:ENSMMUG00000001160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 4 // 8 // 0 /// ENSMMUT00000001638 // ENSEMBL // cdna:known_by_projection chromosome:MMUL_1:1:1697950:1701289:1 gene:ENSMMUG00000001160 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 6 // 12 // 0 |
main |
chr1(+):1688710-1703306 |
| 13579715 |
13579715 |
chr1 |
+ |
1708790 |
1719682 |
10 |
ENSMMUT00000001638 // LOC722345 // max dimerization protein 4-like // --- // 722345 /// ENSMMUT00000001638 // LOC722345 // max dimerization protein 4-like // --- // 722345 |
GENSCAN00000117419 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214689003:3384:12990:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 4 // 8 // 0 /// XM_002802163 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta DNA polymerase nu-like (LOC722353), mRNA. // chr1 // 43 // 43 // 3 // 7 // 1 /// ENSMMUT00000001633 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:1708790:1719682:1 gene:ENSMMUG00000001158 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 10 // 23 // 1 |
main |
chr1(+):1708790-1719682 |
| 13579724 |
13579724 |
chr1 |
+ |
1722282 |
1878617 |
11 |
ENSMMUT00000047702 // LOC722353 // DNA polymerase nu-like // --- // 722353 /// ENSMMUT00000001632 // LOC722353 // DNA polymerase nu-like // --- // 722353 |
ENSMMUT00000047702 // ENSEMBL // cdna:known_by_projection chromosome:MMUL_1:1:1722282:1878617:1 gene:ENSMMUG00000001156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 7 // 7 // 0 /// ENSMMUT00000001632 // ENSEMBL // cdna:known_by_projection chromosome:MMUL_1:1:1778772:1878615:1 gene:ENSMMUG00000001156 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 100 // 100 // 3 // 3 // 0 |
main |
chr1(+):1722282-1878617 |
| 13579749 |
13579749 |
chr1 |
+ |
1947483 |
1975300 |
12 |
ENSMMUT00000013885 // WHSC2 // Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2 // --- // 712689 |
AB172607 // GenBank // Macaca fascicularis brain cDNA clone: QflA-18928, similar to human Wolf-Hirschhorn syndrome candidate 2 (WHSC2), mRNA, RefSeq: NM_005663.2. // chr1 // 83 // 83 // 5 // 6 // 0 /// GENSCAN00000014897 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214715291:19881:24819:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 3 // 4 // 0 /// ENSMMUT00000013885 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:1947483:1975300:1 gene:ENSMMUG00000009944 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 0 |
main |
chr1(+):1947483-1975300 |
| 13579762 |
13579762 |
chr1 |
+ |
2103591 |
2145636 |
6 |
ENSMMUT00000028035 // LETM1 // --- // --- // --- |
ENSMMUT00000028035 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2103591:2145636:1 gene:ENSMMUG00000019948 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 63 // 63 // 5 // 8 // 0 |
main |
chr1(+):2103591-2145636 |
| 13579775 |
13579775 |
chr1 |
+ |
2241004 |
2247075 |
11 |
XR_012625 // LOC712960 // transmembrane protein 129-like // --- // 712960 /// ENSMMUT00000015651 // TMEM129 // --- // --- // --- |
XR_012625 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta transmembrane protein 129-like (LOC712960), miscRNA. // chr1 // 67 // 67 // 8 // 12 // 0 /// GENSCAN00000040084 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214600069:833:10839:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 70 // 70 // 7 // 10 // 0 /// ENSMMUT00000015651 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2241004:2247075:1 gene:ENSMMUG00000011190 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 57 // 57 // 8 // 14 // 0 |
main |
chr1(+):2241004-2247075 |
| 13579780 |
13579780 |
chr1 |
+ |
2251085 |
2271755 |
13 |
XM_002802171 // LOC722546 // histone RNA hairpin-binding protein-like // --- // 722546 /// ENSMMUT00000047698 // SLBP // --- // --- // --- |
XM_002802171 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta histone RNA hairpin-binding protein-like (LOC722546), mRNA. // chr1 // 75 // 75 // 3 // 4 // 0 /// GENSCAN00000113209 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214654483:6441:6557:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 3 // 4 // 0 /// ENSMMUT00000047698 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2251085:2271755:1 gene:ENSMMUG00000032303 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 10 // 20 // 0 |
main |
chr1(+):2251085-2271755 |
| 13579789 |
13579789 |
chr1 |
+ |
2288259 |
2288368 |
8 |
--- |
ENSMMUT00000037274 // ENSEMBL // ncrna:misc_RNA chromosome:MMUL_1:1:2288259:2288368:1 gene:ENSMMUG00000027605 gene_biotype:misc_RNA transcript_biotype:misc_RNA // chr1 // 100 // 100 // 8 // 8 // 0 |
main |
chr1(+):2288259-2288368 |
| 13579791 |
13579791 |
chr1 |
+ |
2302475 |
2331316 |
6 |
--- |
XM_001118686 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta protein FAM53A-like (LOC722555), partial mRNA. // chr1 // 40 // 40 // 2 // 5 // 1 /// ENSMMUT00000011694 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2302475:2331316:1 gene:ENSMMUG00000008363 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 43 // 43 // 6 // 14 // 1 |
main |
chr1(+):2302475-2331316 |
| 13579797 |
13579797 |
chr1 |
+ |
2540278 |
2540394 |
10 |
XM_001082431 // LOC693722 // NK1 transcription factor-related protein 1-like // --- // 693722 |
XM_001082431 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta NK1 transcription factor-related protein 1-like (LOC693722), mRNA. // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 0 /// GENSCAN00000021417 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214667277:16373:17256:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 0 /// ENSMMUT00000028328 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2540278:2540394:1 gene:ENSMMUG00000032301 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 71 // 71 // 10 // 14 // 0 |
main |
chr1(+):2540278-2540394 |
| 13579799 |
13579799 |
chr1 |
+ |
2718056 |
2754975 |
13 |
NM_001266780 // CTBP1 // C-terminal binding protein 1 // --- // 694507 /// ENSMMUT00000047695 // CTBP1 // C-terminal binding protein 1 // --- // 694507 /// ENSMMUT00000047694 // CTBP1 // C-terminal binding protein 1 // --- // 694507 /// ENSMMUT00000011642 // CTBP1 // C-terminal binding protein 1 // --- // 694507 |
NM_001266780 // RefSeq // Macaca mulatta C-terminal binding protein 1 (CTBP1), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 7 // 11 // 0 /// GENSCAN00000022528 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214667265:17178:33301:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 75 // 75 // 3 // 4 // 0 /// ENSMMUT00000047695 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2718056:2754975:1 gene:ENSMMUG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 56 // 56 // 5 // 9 // 0 /// ENSMMUT00000047694 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2718057:2754975:1 gene:ENSMMUG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 4 // 6 // 0 /// ENSMMUT00000011642 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2718057:2754975:1 gene:ENSMMUG00000008323 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 50 // 50 // 3 // 6 // 0 |
main |
chr1(+):2718056-2754975 |
| 13579812 |
13579812 |
chr1 |
+ |
2794182 |
2799713 |
13 |
XM_001092523 // SPON2 // spondin 2, extracellular matrix protein // --- // 702450 /// ENSMMUT00000029333 // SPON2 // spondin 2, extracellular matrix protein // --- // 702450 |
XM_001092523 // RefSeq // PREDICTED: Macaca mulatta spondin 2, extracellular matrix protein (SPON2), mRNA. // chr1 // 64 // 64 // 9 // 14 // 0 /// GENSCAN00000115254 // ENSEMBL // cdna:genscan contig::1099214667261:12103:17074:-1 transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 67 // 67 // 10 // 15 // 0 /// ENSMMUT00000029333 // ENSEMBL // cdna:known chromosome:MMUL_1:1:2794182:2799713:1 gene:ENSMMUG00000020856 gene_biotype:protein_coding transcript_biotype:protein_coding // chr1 // 53 // 53 // 10 // 19 // 0 |
main |
chr1(+):2794182-2799713 |
Less...
More...