GEO help: Mouse over screen elements for information.
Status
Public on Dec 18, 2017
Title
ZB/SBS-NTU Plasmodium falciparum 3D7 11.4K v1.2
Technology type
spotted oligonucleotide
Distribution
non-commercial
Organism
Plasmodium falciparum Manufacturer
ZB lab/SBS-NTU
Manufacture protocol
Long oligonucleotides were selected using the program OligoRankPick, described in Guangan Hu, Manuel Llinás, Jingguang Li, Peter Rainer Preiser & Zbynek Bozdech: Selection of long oligonucleotides for gene expression microarrays using weighted rank-sum strategy. BMC Bioinformatics 2007, 8:350.
Submission date
Dec 13, 2017
Last update date
Dec 13, 2017
Contact name
Margaret Jane Mackinnon
Organization name
None
Street address
None
City
None
State/province
None
ZIP/Postal code
1111
Country
Australia
Samples (510)
GSM2887799 , GSM2887800 , GSM2887801 , GSM2887802 , GSM2887803 , GSM2887804
GSM2887808 ,
GSM2887813 ,
GSM2887820 ,
GSM2887821 ,
GSM2887822 ,
GSM2887823 ,
GSM2887824 ,
GSM2887825 ,
GSM2887826 ,
GSM2887829 ,
GSM2887834 ,
GSM2887840 ,
GSM2887841 ,
GSM2887842 ,
GSM2887843 ,
GSM2887844 ,
GSM2887845 ,
GSM2887846 ,
GSM2887847 ,
GSM2887848 ,
GSM2887849 ,
GSM2887850 ,
GSM2887851 ,
GSM2887852 ,
GSM2887853 ,
GSM2887854 ,
GSM2887855 ,
GSM2887856 ,
GSM2887857 ,
GSM2887858 ,
GSM2887859 ,
GSM2887860 ,
GSM2887861 ,
GSM2887862 ,
GSM2887863 ,
GSM2887864 ,
GSM2887865 ,
GSM2887866 ,
GSM2887867 ,
GSM2887871 ,
GSM2887872 ,
GSM2887873 ,
GSM2887874 ,
GSM2887875 ,
GSM2887876 ,
GSM2887877 ,
GSM2887878 ,
GSM2887879 ,
GSM2887880 ,
GSM2887881 ,
GSM2887882 ,
GSM2887883 ,
GSM2887884 ,
GSM2887885 ,
GSM2887886 ,
GSM2887887 ,
GSM2887888 ,
GSM2887889 ,
GSM2887890 ,
GSM2887891 ,
GSM2887892 ,
GSM2887893 ,
GSM2887894 ,
GSM2887895 ,
GSM2887896 ,
GSM2887897 ,
GSM2887898 ,
GSM2887900 ,
GSM2887901 ,
GSM2887902 ,
GSM2887903 ,
GSM2887904 ,
GSM2887905 ,
GSM2887911 ,
GSM2887912 ,
GSM2887919 ,
GSM2888066 ,
GSM2888067 ,
GSM2888068 ,
GSM2888069 ,
GSM2888070 ,
GSM2888071 ,
GSM2888072 ,
GSM2888073 ,
GSM2888074 ,
GSM2888075 ,
GSM2888076 ,
GSM2888077 ,
GSM2888078 ,
GSM2888079 ,
GSM2888080 ,
GSM2888081 ,
GSM2888082 ,
GSM2888083 ,
GSM2888084 ,
GSM2888085 ,
GSM2888086 ,
GSM2888087 ,
GSM2888088 ,
GSM2888089 ,
GSM2888090 ,
GSM2888091 ,
GSM2888092 ,
GSM2888093 ,
GSM2888094 ,
GSM2888095 ,
GSM2888096 ,
GSM2888097 ,
GSM2888098 ,
GSM2888099 ,
GSM2888100 ,
GSM2888101 ,
GSM2888102 ,
GSM2888103 ,
GSM2888104 ,
GSM2888105 ,
GSM2888106 ,
GSM2888107 ,
GSM2888108 ,
GSM2888109 ,
GSM2888110 ,
GSM2888111 ,
GSM2888112 ,
GSM2888113 ,
GSM2888114 ,
GSM2888115 ,
GSM2888116 ,
GSM2888117 ,
GSM2888118 ,
GSM2888119 ,
GSM2888120 ,
GSM2888121 ,
GSM2888122 ,
GSM2888123 ,
GSM2888124 ,
GSM2888125 ,
GSM2888126 ,
GSM2888127 ,
GSM2888128 ,
GSM2888129 ,
GSM2888130 ,
GSM2888131 ,
GSM2888132 ,
GSM2888133 ,
GSM2888134 ,
GSM2888135 ,
GSM2888136 ,
GSM2888137 ,
GSM2888138 ,
GSM2888139 ,
GSM2888140 ,
GSM2888141 ,
GSM2888142 ,
GSM2888143 ,
GSM2888144 ,
GSM2888145 ,
GSM2888146 ,
GSM2888147 ,
GSM2888148 ,
GSM2888149 ,
GSM2888150 ,
GSM2888151 ,
GSM2888152 ,
GSM2888153 ,
GSM2888154 ,
GSM2888155 ,
GSM2888156 ,
GSM2888157 ,
GSM2888158 ,
GSM2888159 ,
GSM2888160 ,
GSM2888161 ,
GSM2888162 ,
GSM2888163 ,
GSM2888164 ,
GSM2888165 ,
GSM2888166 ,
GSM2888167 ,
GSM2888168 ,
GSM2888169 ,
GSM2888170 ,
GSM2888171 ,
GSM2888172 ,
GSM2888173 ,
GSM2888174 ,
GSM2888175 ,
GSM2888176 ,
GSM2888177 ,
GSM2888178 ,
GSM2888179 ,
GSM2888180 ,
GSM2888181 ,
GSM2888182 ,
GSM2888183 ,
GSM2888184 ,
GSM2888185 ,
GSM2888186 ,
GSM2888187 ,
GSM2888188 ,
GSM2888189 ,
GSM2888190 ,
GSM2888191 ,
GSM2888192 ,
GSM2888193 ,
GSM2888194 ,
GSM2888195 ,
GSM2888196 ,
GSM2888197 ,
GSM2888198 ,
GSM2888199 ,
GSM2888200 ,
GSM2888201 ,
GSM2888202 ,
GSM2888203 ,
GSM2888204 ,
GSM2888205 ,
GSM2888206 ,
GSM2888207 ,
GSM2888208 ,
GSM2888209 ,
GSM2888210 ,
GSM2888211 ,
GSM2888212 ,
GSM2888213 ,
GSM2888214 ,
GSM2888215 ,
GSM2888216 ,
GSM2888217 ,
GSM2888218 ,
GSM2888219 ,
GSM2888220 ,
GSM2888221 ,
GSM2888222 ,
GSM2888223 ,
GSM2888224 ,
GSM2888225 ,
GSM2888226 ,
GSM2888227 ,
GSM2888228 ,
GSM2888229 ,
GSM2888230 ,
GSM2888231 ,
GSM2888232 ,
GSM2888233 ,
GSM2888234 ,
GSM2888235 ,
GSM2888236 ,
GSM2888237 ,
GSM2888238 ,
GSM2888239 ,
GSM2888240 ,
GSM2888241 ,
GSM2888242 ,
GSM2888243 ,
GSM2888244 ,
GSM2888245 ,
GSM2888246 ,
GSM2888247 ,
GSM2888248 ,
GSM2888249 ,
GSM2888250 ,
GSM2888251 ,
GSM2888252 ,
GSM2888253 ,
GSM2888254 ,
GSM2888255 ,
GSM2888256 ,
GSM2888257 ,
GSM2888258 ,
GSM2888259 ,
GSM2888260 ,
GSM2888261 ,
GSM2888262 ,
GSM2888263 ,
GSM2888264 ,
GSM2888265 ,
GSM2888266 ,
GSM2888267 ,
GSM2888268 ,
GSM2888269 ,
GSM2888270 ,
GSM2888271 ,
GSM2888272 ,
GSM2888273 ,
GSM2888274 ,
GSM2888275 ,
GSM2888276 ,
GSM2888277 ,
GSM2888278 ,
GSM2888279 ,
GSM2888280 ,
GSM2888281 ,
GSM2888282 ,
GSM2888283 ,
GSM2888284 ,
GSM2888285 ,
GSM2888286 ,
GSM2888287 ,
GSM2888288 ,
GSM2888289 ,
GSM2888290 ,
GSM2888291 ,
GSM2888292 ,
GSM2888293 ,
GSM2888294 ,
GSM2888295 ,
GSM2888296 ,
GSM2888297 ,
GSM2888298 ,
GSM2888299 ,
GSM2888300 ,
GSM2888301 ,
GSM2888302 ,
GSM2888303 ,
GSM2888304 ,
GSM2888305 ,
GSM2888306 ,
GSM2888307 ,
GSM2888308 ,
GSM2888309 ,
GSM2888310 ,
GSM3096195 ,
GSM3096196 ,
GSM3096197 ,
GSM3096198 ,
GSM3096199 ,
GSM3096200 ,
GSM3096201 ,
GSM3096202 ,
GSM3096203 ,
GSM3096204 ,
GSM3096205 ,
GSM3096206 ,
GSM3096207 ,
GSM3096208 ,
GSM3096209 ,
GSM3096210 ,
GSM3096211 ,
GSM3096212 ,
GSM3096213 ,
GSM3096214 ,
GSM3096215 ,
GSM3096216 ,
GSM3096217 ,
GSM3096218 ,
GSM3096219 ,
GSM3096220 ,
GSM3096221 ,
GSM3096222 ,
GSM3096223 ,
GSM3096224 ,
GSM3096225 ,
GSM3096226 ,
GSM3096227 ,
GSM3096228 ,
GSM3096229 ,
GSM3096230 ,
GSM3096231 ,
GSM3096232 ,
GSM3096233 ,
GSM3096234 ,
GSM3096235 ,
GSM3096236 ,
GSM3096237 ,
GSM3096238 ,
GSM3096239 ,
GSM3096240 ,
GSM3096241 ,
GSM3096242 ,
GSM3096243 ,
GSM3096244 ,
GSM3096245 ,
GSM3096246 ,
GSM3096247 ,
GSM3096248 ,
GSM3096249 ,
GSM3096250 ,
GSM3096251 ,
GSM3096252 ,
GSM3096253 ,
GSM3096254 ,
GSM3096255 ,
GSM3096256 ,
GSM3096257 ,
GSM3096258 ,
GSM3096259 ,
GSM3096260 ,
GSM3096261 ,
GSM3096262 ,
GSM3096263 ,
GSM3096264 ,
GSM3096265 ,
GSM3096266 ,
GSM3096267 ,
GSM3096268 ,
GSM3096269 ,
GSM3096270 ,
GSM3096271 ,
GSM3096272 ,
GSM3096273 ,
GSM3096274 ,
GSM3096275 ,
GSM3096276 ,
GSM3096277 ,
GSM3096278 ,
GSM3096279 ,
GSM3096280 ,
GSM3096281 ,
GSM3096282 ,
GSM3096283 ,
GSM3096284 ,
GSM3096285 ,
GSM3096286 ,
GSM3096287 ,
GSM3096288 ,
GSM3096289 ,
GSM3096290 ,
GSM3096291 ,
GSM3096292 ,
GSM3096293 ,
GSM3096294 ,
GSM3096295 ,
GSM3096296 ,
GSM3096297 ,
GSM3096298 ,
GSM3096299 ,
GSM3096300 ,
GSM3096301 ,
GSM3096302 ,
GSM3096303 ,
GSM3096304 ,
GSM3096305 ,
GSM3096306 ,
GSM3096307 ,
GSM3096308 ,
GSM3096309 ,
GSM3096310 ,
GSM3096311 ,
GSM3096312 ,
GSM3096313 ,
GSM3096314 ,
GSM3096315 ,
GSM3096316 ,
GSM3096317 ,
GSM3096318 ,
GSM3096319 ,
GSM3096320 ,
GSM3096321 ,
GSM3096322 ,
GSM3096323 ,
GSM3096324 ,
GSM3096325 ,
GSM3096326 ,
GSM3096327 ,
GSM3096328 ,
GSM3096329 ,
GSM3096330 ,
GSM3096331 ,
GSM3096332 ,
GSM3096333 ,
GSM3096334 ,
GSM3096335 ,
GSM3096336 ,
GSM3096337 ,
GSM3096338 ,
GSM3096339 ,
GSM3096340 ,
GSM3096341 ,
GSM3096342 ,
GSM3096343 ,
GSM3096344 ,
GSM3096345 ,
GSM3096346 ,
GSM3096347 ,
GSM3096348 ,
GSM3096349 ,
GSM3096350 ,
GSM3096351 ,
GSM3096352 ,
GSM3096353 ,
GSM3096354 ,
GSM3096355 ,
GSM3096356 ,
GSM3096357 ,
GSM3096358 ,
GSM3096359 ,
GSM3096360 ,
GSM3096361 ,
GSM3096362 ,
GSM3096363 ,
GSM3096364 ,
GSM3096365 ,
GSM3096366 ,
GSM3096367 ...
Accession list truncated, click here to browse through all related public accessions You can also download a list of all accessions here Series (2)
GSE108034 Ex vivo P. falciparum from High vs Low transmission areas in east Africa
GSE113087 Copy number variation in ex vivo P. falciparum from High vs Low transmission areas in east Africa
Data table header descriptions ID SEQUENCE Oligonucleotide sequence
ORF GeneID in PlasmoDB (at http://www.plasmodb.org)
Annotation Gene annotation
Chromosome Chromosome Number
Position Oligonucleotide location on chromosome
SPOT_ID spot id
Data table ID SEQUENCE ORF Annotation Chromosome Position SPOT_ID ac11rRNA18s_0
AGGCGCGTAAATTACCCAATTCTAAAAAAGAGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAATATCGAAAAAT
c11rRNA18s
NA
NA
c11rRNA18s
ac11rRNA18s_1
GCCCGTCGCTCCTACCGATTGAAAGATATGATGAATTGTTTGGATATGAATTAAAATAATGAAATTTTAT
c11rRNA18s
NA
NA
c11rRNA18s
ac11rRNA28s_0
ATAGTACCTGAAATCGTTAAGGTGGAACGGATTAAGAAAGGAAAATGTAAGAAGATAGTAAATATTACTC
c11rRNA28s
NA
NA
c11rRNA28s
ac11rRNA28s_1
AAAAGGATTGGCTCTGAGGACATTAGAAAAGAGAAGAAAAAAAAGGGGGTTGAAAATAAAATTACAGATT
c11rRNA28s
NA
NA
c11rRNA28s
ac11rRNA28s_2
CTGGGTTTAGACCGTCGTGAGACAGGTTAGTTTTACCCTACTGATGAATTTTATTATATTTTTTATATAT
c11rRNA28s
NA
NA
c11rRNA28s
ac11rRNA5.8s_0
AAATGCAATTACTGTGAATCATCAGAATGCTGAATGTAAACTATACCATATTTACCCTTATGGGCAAATT
c11rRNA5.8s
NA
NA
c11rRNA5.8s
ac11rRNAITS1_0
CACCAACAATATTGAATACTCAAACTTTTTACATAATTATTTGTTTTATATATATATATAATATCTTTAT
c11rRNAITS1
NA
NA
c11rRNAITS1
ac11rRNAITS2_0
ACAATACTTTGTGCTTCTCTGGTTTTTTTTTTGTGATATGTTATATTTTAATCATATATATATATTATCA
c11rRNAITS2
NA
NA
c11rRNAITS2
ac13rRNA18s_0
ATAGTACCTGAAATCGTTAAGGTGGAACGGATTAAGAAAGGAAAATGTAAGAAGATAGTAAATATTACTC
c13rRNA18s
NA
NA
c13rRNA18s
ac13rRNA18s_1
AAAAGGATTGGCTCTGAGGACATTAGAAAAGAGAAGAAAAAAAAGGGGGTTGAAAATAAAATTACAGATT
c13rRNA18s
NA
NA
c13rRNA18s
ac13rRNA18s_2
ATATATATATATACATATAGTATTGTGACAGTAATCCAACTTGGTACGAGAGGATTAGTTGGTTCAGACA
c13rRNA18s
NA
NA
c13rRNA18s
ac13rRNA28s_0
AGGCGCGTAAATTACCCAATTCTAAAAAAGAGAGGTAGTGACAAGAAATAACAATACAATATCGAAAAAT
c13rRNA28s
NA
NA
c13rRNA28s
ac13rRNA28s_1
GCCCGTCGCTCCTACCGATTGAAAGATATGATGAATTGTTTGGATATGAATTAAAATAATGAAATTTTAT
c13rRNA28s
NA
NA
c13rRNA28s
ac13rRNA5.8s_0
AAATGCAATTACTGTGAATCATCAGAATGCTGAATGTAAACTATACCATATTTACCCTTATGGGCAAATT
c13rRNA5.8s
NA
NA
c13rRNA5.8s
ac13rRNAITS1_0
ACAATACTTTTGTGCTTCTCTGGTTTTTTTTTTGTGATATGTTATATTTTAATCATATATATATATTATC
c13rRNAITS1
NA
NA
c13rRNAITS1
ac13rRNAITS2_0
CACCAACAATATTGAATACTCAAAATTTTGCATAATTATTTGTTTTATATATATATATATAATATCTTTA
c13rRNAITS2
NA
NA
c13rRNAITS2
ac14rRNA.1-5s_0
TCGTTCATACTACAGTGGCCACACCAGATCCCATCAGAACTCTGAAGTTAAGCACTGTAAGGCTTGGCTA
c14rRNA.1-5s
NA
NA
c14rRNA.1-5s
ac14rRNA.2-5s_0
TCGTTCATACTACAGTGGCCACACCAGATCCCATCAGAACTCTGAAGTTAAGCACTGTAAGGCTTGGCTA
c14rRNA.2-5s
NA
NA
c14rRNA.2-5s
ac14rRNA.3-5s_0
TCGTTCATACTACAGTGGCCACACCAGATCCCATCAGAACTCTGAAGTTAAGCACTGTAAGGCTTGGCTA
c14rRNA.3-5s
NA
NA
c14rRNA.3-5s
ac1rRNA18s_0
CATGCAAGTGAAAGTACATATGTAAGTAATATATTGAAACTGCGAACGGCTCATTAAAACAGTTATAATC
c1rRNA18s
NA
NA
c1rRNA18s
11372 1437 Kbytes .Supplementary data files not provided
Less...
More...