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Platform GPL4273 Query DataSets for GPL4273
Status Public on Sep 08, 2006
Title UNC Saccharomyces cerevisiae 15K ORF_intergenic_P
Technology type spotted DNA/cDNA
Distribution non-commercial
Organism Saccharomyces cerevisiae
Manufacturer Jason Lieb lab in UNC
Manufacture protocol as described in Iyer et al. 2001
Support glass
Coating polysine
 
Description 15230 spots
 
Web link http://genome.unc.edu
Contributor(s) Lieb JD
Submission date Sep 06, 2006
Last update date Oct 13, 2006
Contact name Jason D Lieb
E-mail(s) jlieb@bio.unc.edu
Phone (919) 843-3228
Fax (919) 962-1625
URL http://www.bio.unc.edu/faculty/lieb/labpages/home.shtml
Organization name University of North Carolina at Chapel Hill
Department Department of Biology
Street address CB# 3280, 202 Fordham Hall
City Chapel Hill
State/province NC
ZIP/Postal code 27599-3280
Country USA
 
Samples (3) GSM134887, GSM135512, GSM135521
Series (3)
GSE5780 Leu3 ChIP-chip
GSE5785 Comparison of Leu3 binding in vitro and in vivo
GSE6016 DIP-chip: Rapid and accurate determination of DNA-binding specificity

Data table header descriptions
ID
Block block on the array
Column Column within block
Row Row within block
NAME genomic segment
ORF
SPOT_ID
SUID Stanford ID
SEQUENCE sequence of fragments on the array

Data table
ID Block Column Row NAME ORF SPOT_ID SUID SEQUENCE
1 1 1 1 YAL001C YAL001C 329 TATGGTACTGACGATTTATCCTGACGAACTCGTACAAATAGTGTCTGATAAAATTGCTTCAAATAAGGGAAAAATCACTTTGAATCAGCTGTGGGATATATCTGGTAAATATTTTGATTTGTCTGATAAAAAAGTTAAACAGTTCGTGCTTTCATGCGTGATATTGAAAAAGGACATTGAGGTGTATTGTGATGGTGCTATAACAACTAAAAATGTGACTGATATTATAGGCGACGCTAATCATTCATACTCGGTTGGGATTACTGAGGACAGCCTATGGACATTATTAACGGGATACACAAAAAAGGAGTCAACTATTGGAAATTCTGCATTTGAACTACTTCTCGAAGTTGCCAAATCAGGAGAAAAAGGGATCAATACTATGGATTTGGCGCAGGTAACTGGGCAAGATCCTAGAAGTGTGACTGGACGTATCAAGAAAATAAACCACCTGTTAACAAGTTCACAACTGATTTATAAGGGACACGTCGTGAAGCAATTGAAGCTAAAAAAATTCAGCCATGACGGGGTGGATAGTAATCCCTATATTAATATTAGGGATCATTTAGCAACAATAGTTGAGGTGGTAAAACGATCAAAAAATGGTATTCGCCAGATAATTGATTTAAAGCGTGAATTGAAATTTGACAAAGAGAAAAGACTTTCTAAAGCTTTTATTGCAGCTATTGCATGGTTAGATGAAAAGGAGTACTTAAAGAAAGTGCTTGTAGTATCACCCAAGAATCCTGCCATTAAAATCAGATGTGTAAAATACGTGAAAGATATTCCAGACTCTAAAGGCTCGCCTTCATTTGAGTATGATAGCAATAGCGCGGATGAAGATTCTGTATCAGATAGCAAGGCAGCTTTCGAAGATGAAGACTTAGTCGAAGGTTTAGATAATTTCAATGCGACTGATTTATTACAAAATCAAGGCCTTGTTATGGAAGAGAAAGAGGATGCTGTAAAGAATGAAGTTCTTCTTAATCGATTTTATCCACTTCAAAATCAGACTTATGACATTGCAGATAAGTCTGGCCTTAAAGGAATTTCAACTATGGATGTTGTAAATCGAATTACCGGAAAAGAATTTCAGCGAGCTTTTACCAAATCAAGCGAATATTATTTAGAAAGTGTGGATAAGCAAAAAGAAAATACAGGGGGGTATAGGCTTTTTCGCATATACGATTTTGAGGGAAAGAAGAAGTTTTTTAGGCTGTTCACAGCTCAGAACTTTCAAAAGTTAACAAATGCGGAAGACGAAATATCCGTTCCAAAAGGGTTTGATGAGCTAGGCAAATCTCGTACCGATTTGAAAACTCTCAACGAGGATAATTTCGTCGCACTCAACAACACTGTTAGATTTACAACGGACAGCGATGGACAGGATATATTCTTCTGGCACGGTGAATTAAAAATTCCCCCAAACTCAAAAAAAACTCCGAATAAAAACAAACGGAAGAGGCAGGTTAAAAACAGTACTAATGCTTCTGTTGCAGGAAACATTTCGAATCCCAAAAGGATTAAGCTAGAGCAGCATGTCAGCACTGCACAGGAGCCGAAATCTGCTGAAGATAGTCCAAGTTCAAACGGAGGCACTGTTGTCAAAGGCAAGGTGGTTAACTTCGGCGGCTTTTCTGCCCGCTCTTTGCGTTCACTACAGAGACAGAGAGCCATTTTGAAAGTTATGAATACGATTGGTGGGGTAGCATACCTGAGAGAACAATTTTACGAAAGCGTTTCTAAATATATGGGCTCCACAACGACATTAGATAAAAAGACTGTCCGTGGTGATGTTGATTTGATGGTAGAAAGCGAAAAATTAGGAGCCAGAACAGAGCCTGTATCAGGAAGAAAAATTATTTTTTTGCCCACTGTTGGAGAGGACGCTATCCAAAGGTACATCCTGAAAGAAAAAGATAGTAAAAAAGCAACCTTTACTGATGTTATACATGATACGGAAATATACTTCTTTGACCAAACGGAAAAAAATAGGTTTCACAGAGGAAAGAAATCAGTTGAAAGAATTCGTAAGTTTCAGAACCGCCAAAAGAATGCTAAGATCAAAGCTTCAGATGACGCTATCTCTAAGAAGAGTACGTCGGTCAACGTATCAGATGGAAAGATCAAAAGGAGAGACAAAAAAGTGTCTGCTGGTAGGACAACGGTGGTCGTGGAAAATACTAAAGAAGACAAAACTGTCTATCATGCAGGCACTAAAGATGGTGTTCAGGCTTTAATCAGAGCTGTTGTAGTTACTAAAAGTATTAAAAATGAAATAATGTGGGACAAAATAACAAAATTATTTCCTAATAATTCTTTAGATAACCTAAAAAAGAAATGGACGGCACGGCGAGTAAGAATGGGTCATAGTGGTTGGAGGGCATATGTCGATAAGTGGAAAAAAATGCTCGTTCTAGCCATTAAAAGTGAAAAGATTTCACTGAGGGATGTTGAAGAACTAGATCTTATCAAATTGCTTGATATTTGGACCTCTTTTGATGAAAAGGAAATAAAAAGGCCGCTCTTTCTTTATAAGAACTACGAAGAGAATAGAAAAAAATTTACTCTGGTACGTGATGACACACTTACACATTCTGGCAACGATCTGGCCATGTCTTCTATGATTCAAAGAGAGATCTCTTCTTTAAAAAAAACTTACACTAGAAAGATTTCCGCTTCTACTAAGGACTTATCGAAGAGTCAAAGCGACGATTATATTCGCACAGTGATCCGGTCCATATTAATAGAAAGTCCTTCGACCACTAGAAATGAAATAGAGGCGTTGAAGAACGTTGGAAACGAATCAATAGATAACGTCATCATGGATATGGCTAAGGAAAAGCAAATTTATCTCCATGGCTCAAAACTTGAATGTACTGATACTTTACCAGACATTTTGGAAAATAGAGGAAATTATAAAGATTTTGGTGTAGCTTTTCAGTATAGATGTAAGGTTAATGAATTATTGGAGGCCGGAAACGCTATTGTTATCAATCAAGAGCCGTCCGATATATCCTCTTGGGTTTTAATTGATTTGATTTCGGGAGAGCTATTGAATATGGATGTAATTCCAATGGTGAGAAATGTTCGACCTTTAACGTATACTTCAAGGAGATTTGAAATACGAACATTAACTCCCCCTCTGATTATATATGCCAATTCTCAGACAAAATTGAATACAGCAAGGAAGTCTGCTGTCAAAGTTCCACTGGGCAAACCATTTTCTCGTTTATGGGTGAATGGATCTGGTTCCATTAGGCCAAACATATGGAAGCAGGTAGTTACTATGGTCGTTAACGAAATAATATTTCATCCAGGGATAACATTGAGTAGATTGCAATCTAGGTGTCGTGAAGTACTTTCGCTTCATGAAATATCAGAAATATGCAAATGGCTCCTAGAAAGACAAGTATTAATAACTACTGATTTTGATGGCTATTGGGTCAATCATAATTGGTATTCTATATATGAATCTACATAA
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9 1 9 1 YAL054C YAL054C 378 TATGTCGCCCTCTGCCGTACAATCATCAAAACTAGAAGAACAGTCAAGTGAAATTGACAAGTTGAAAGCAAAAATGTCCCAGTCTGCCGCCACTGCGCAGCAGAAGAAGGAACATGAGTATGAACATTTGACTTCGGTCAAGATCGTGCCACAACGGCCCATCTCAGATAGACTGCAGCCCGCAATTGCTACCCACTATTCTCCACACTTGGACGGGTTGCAGGACTATCAGCGCTTGCACAAGGAGTCTATTGAAGACCCTGCTAAGTTCTTCGGTTCTAAAGCTACCCAATTTTTAAACTGGTCTAAGCCATTCGATAAGGTGTTCATCCCAGACCCTAAAACGGGCAGGCCCTCCTTCCAGAACAATGCATGGTTCCTCAACGGCCAATTAAACGCCTGTTACAACTGTGTTGACAGACATGCCTTGAAGACTCCTAACAAGAAAGCCATTATTTTCGAAGGTGACGAGCCTGGCCAAGGCTATTCCATTACCTACAAGGAACTACTTGAAGAAGTTTGTCAAGTGGCACAAGTGCTGACTTACTCTATGGGCGTTCGCAAGGGCGATACTGTTGCCGTGTACATGCCTATGGTCCCAGAAGCAATCATAACCTTGTTGGCCATTTCCCGTATCGGTGCCATTCACTCCGTAGTCTTTGCCGGGTTTTCTTCCAACTCCTTGAGAGATCGTATCAACGATGGGGACTCTAAAGTTGTCATCACTACAGATGAATCCAACAGAGGTGGTAAAGTCATTGAGACTAAAAGAATTGTTGATGACGCGCTAAGAGAGACCCCAGGCGTGAGACACGTCTTGGTTTATAGAAAGACCAACAATCCATCTGTTGCTTTCCATGCCCCCAGAGATTTGGATTGGGCAACAGAAAAGAAGAAATACAAGACCTACTATCCATGCACACCCGTTGATTCTGAGGATCCATTATTCTTGTTGTATACGTCTGGTTCTACTGGTGCCCCCAAGGGTGTTCAACATTCTACCGCAGGTTACTTGCTGGGAGCTTTGTTGACCATGCGCTACACTTTTGACACTCACCAAGAAGACGTTTTCTTCACAGCTGGAGACATTGGCTGGATTACAGGCCACACTTATGTGGTTTATGGTCCCTTACTATATGGTTGTGCCACTTTGGTCTTTGAAGGGACTCCTGCGTACCCAAATTACTCCCGTTATTGGGATATTATTGATGAACACAAAGTCACCCAATTTTATGTTGCGCCAACTGCTTTGCGTTTGTTGAAAAGAGCTGGTGATTCCTACATCGAAAATCATTCCTTAAAATCTTTGCGTTGCTTGGGTTCGGTCGGTGAGCCAATTGCTGCTGAAGTTTGGGAGTGGTACTCTGAAAAAATAGGTAAAAATGAAATCCCCATTGTAGACACCTACTGGCAAACAGAATCTGGTTCGCATCTGGTCACCCCGCTGGCTGGTGGTGTTACACCAATGAAACCGGGTTCTGCCTCATTCCCCTTCTTCGGTATTGATGCAGTTGTTCTTGACCCTAACACTGGTGAAGAACTTAACACCAGCCACGCAGAGGGTGTCCTTGCCGTCAAAGCTGCATGGCCATCATTTGCAAGAACTATTTGGAAAAATCATGATAGGTATCTAGACACTTATTTGAACCCTTACCCTGGCTACTATTTCACTGGTGATGGTGCTGCAAAGGATAAGGATGGTTATATCTGGATTTTGGGTCGTGTAGACGATGTGGTGAACGTCTCTGGTCACCGTCTGTCTACCGCTGAAATTGAGGCTGCTATTATCGAAGATCCAATTGTGGCCGAGTGTGCTGTTGTCGGATTCAACGATGACTTGACTGGTCAAGCAGTTGCTGCATTTGTGGTGTTGAAAAACAAATCTAGTTGGTCCACCGCAACAGATGATGAATTACAAGATATCAAGAAGCATTTGGTCTTTACTGTTAGAAAAGACATCGGGCCATTTGCCGCACCAAAATTGATCATTTTAGTGGATGACTTGCCCAAGACAAGATCCGGCAAAATTATGAGACGTATTTTAAGAAAAATCCTAGCAGGAGAAAGTGACCAACTAGGCGACGTTTCTACATTGTCAAACCCTGGCATTGTTAGACATCTAATTGATTCGGTCAAGTTGTAA
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13 1 13 1 YBR160W YBR160W 3915 ATGAGCGGTGAATTAGCAAATTACAAAAGACTTGAGAAAGTCGGTGAAGGTACATACGGTGTTGTTTATAAAGCGTTAGACTTAAGACCTGGCCAAGGTCAAAGAGTAGTCGCATTGAAGAAAATAAGACTAGAGAGTGAAGACGAGGGTGTTCCCAGTACAGCCATCAGAGAAATCTCATTATTGAAGGAATTAAAAGACGATAATATTGTCAGATTATACGATATTGTTCACTCTGATGCACACAAGCTATATCTTGTTTTTGAGTTCCTCGATTTGGACCTGAAAAGATATATGGAGGGTATTCCAAAGGACCAACCGTTAGGAGCTGATATTGTTAAGAAGTTTATGATGCAACTTTGTAAGGGTATTGCATACTGCCACTCACACCGTATTCTGCATCGTGATTTAAAACCGCAGAACTTATTGATTAACAAAGATGGGAATCTAAAACTAGGTGATTTTGGCTTAGCGCGTGCTTTTGGTGTTCCGTTGAGAGCTTACACACATGAAATTGTTACTCTATGGTATAGAGCTCCGGAGGTATTACTGGGTGGAAAACAATATAGTACAGGTGTCGATACATGGTCCATCGGCTGTATATTTGCCGAAATGTGTAACAGGAAACCAATCTTCAGTGGCGATAGTGAGATCGATCAGATTTTCAAGATATTCAGAGTATTGGGAACGCCGAATGAAGCTATATGGCCAGATATTGTCTACTTGCCTGATTTCAAGCCAAGCTTTCCTCAATGGCGCAGAAAAGACCTATCACAAGTGGTACCAAGTCTAGATCCACGCGGTATTGATTTGTTGGACAAACTCCTCGCGTATGACCCTATTAACCGGATTAGCGCCAGAAGAGCAGCCATCCACCCCTACTTCCAAGAATCATAA
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