GEO Publications
Handout
NAR 2024 (latest)
NAR 2002 (original)
All publications
FAQ
MIAME
Email GEO
NCBI
>
GEO
>
Accession Display
Not logged in |
Login
GEO help:
Mouse over screen elements for information.
Scope:
Self
Platform
Samples
Series
Family
Format:
HTML
SOFT
MINiML
Amount:
Brief
Quick
GEO accession:
Series GSE98653
Query DataSets for GSE98653
Status
Public on Jun 14, 2018
Title
RNA-seq of ten guinea pig tissues from breeders and non-breeders
Organism
Cavia porcellus
Experiment type
Expression profiling by high throughput sequencing
Summary
Comparison of gene expression level by Illumina sequencing of ten different guinea pig tissue from breeders and non-breeders.
Overall design
238 samples: 10 tissues (heart, skin, liver, kidney, cerebellum, hypothalamus, pituitary, thyroid, adrenal, gonad), 5-6 animals per group, 4 groups: 1) female non-breeder, 2) female breeder, 3) male non-breeder, 4) male breeder
Contributor(s)
Bens M
,
Szafranski K
,
Holtze S
,
Sahm A
,
Groth M
,
Hildebrandt TB
,
Platzer M
Citation(s)
30068345
Submission date
May 08, 2017
Last update date
May 15, 2019
Contact name
Marco Groth
E-mail(s)
dnaseq@leibniz-fli.de
Organization name
Leibniz Institute on Aging - FLI
Department
Core Facility - Next Generation Sequencing
Street address
Beutenbergstraße 11
City
Jena
ZIP/Postal code
07747
Country
Germany
Platforms (1)
GPL22346
Illumina HiSeq 2500 (Cavia porcellus)
Samples (238)
Less...
More...
GSM2607739
GP_BF_01_ADR
GSM2607740
GP_BF_02_ADR
GSM2607741
GP_BF_05_ADR
GSM2607742
GP_BF_12_ADR
GSM2607743
GP_BF_14_ADR
GSM2607744
GP_BF_15_ADR
GSM2607745
GP_NF_03_ADR
GSM2607746
GP_NF_06_ADR
GSM2607747
GP_NF_08_ADR
GSM2607748
GP_NF_09_ADR
GSM2607749
GP_NF_11_ADR
GSM2607750
GP_NF_13_ADR
GSM2607751
GP_BM_16_ADR
GSM2607752
GP_BM_20_ADR
GSM2607753
GP_BM_21_ADR
GSM2607754
GP_BM_22_ADR
GSM2607755
GP_BM_24_ADR
GSM2607756
GP_BM_25_ADR
GSM2607757
GP_NM_18_ADR
GSM2607758
GP_NM_19_ADR
GSM2607759
GP_NM_23_ADR
GSM2607760
GP_NM_28_ADR
GSM2607761
GP_NM_29_ADR
GSM2607762
GP_NM_30_ADR
GSM2607763
GP_BF_01_CER
GSM2607764
GP_BF_02_CER
GSM2607765
GP_BF_05_CER
GSM2607766
GP_BF_12_CER
GSM2607767
GP_BF_14_CER
GSM2607768
GP_BF_15_CER
GSM2607769
GP_NF_03_CER
GSM2607770
GP_NF_06_CER
GSM2607771
GP_NF_08_CER
GSM2607772
GP_NF_09_CER
GSM2607773
GP_NF_11_CER
GSM2607774
GP_NF_13_CER
GSM2607775
GP_BM_16_CER
GSM2607776
GP_BM_20_CER
GSM2607777
GP_BM_21_CER
GSM2607778
GP_BM_22_CER
GSM2607779
GP_BM_24_CER
GSM2607780
GP_BM_25_CER
GSM2607781
GP_NM_18_CER
GSM2607782
GP_NM_19_CER
GSM2607783
GP_NM_23_CER
GSM2607784
GP_NM_28_CER
GSM2607785
GP_NM_29_CER
GSM2607786
GP_NM_30_CER
GSM2607787
GP_BF_01_HRT
GSM2607788
GP_BF_02_HRT
GSM2607789
GP_BF_05_HRT
GSM2607790
GP_BF_12_HRT
GSM2607791
GP_BF_14_HRT
GSM2607792
GP_BF_15_HRT
GSM2607793
GP_NF_03_HRT
GSM2607794
GP_NF_06_HRT
GSM2607795
GP_NF_08_HRT
GSM2607796
GP_NF_09_HRT
GSM2607797
GP_NF_11_HRT
GSM2607798
GP_NF_13_HRT
GSM2607799
GP_BM_16_HRT
GSM2607800
GP_BM_20_HRT
GSM2607801
GP_BM_21_HRT
GSM2607802
GP_BM_22_HRT
GSM2607803
GP_BM_24_HRT
GSM2607804
GP_BM_25_HRT
GSM2607805
GP_NM_18_HRT
GSM2607806
GP_NM_19_HRT
GSM2607807
GP_NM_23_HRT
GSM2607808
GP_NM_28_HRT
GSM2607809
GP_NM_29_HRT
GSM2607810
GP_NM_30_HRT
GSM2607811
GP_BF_01_HYP
GSM2607812
GP_BF_02_HYP
GSM2607813
GP_BF_05_HYP
GSM2607814
GP_BF_12_HYP
GSM2607815
GP_BF_14_HYP
GSM2607816
GP_BF_15_HYP
GSM2607817
GP_NF_03_HYP
GSM2607818
GP_NF_06_HYP
GSM2607819
GP_NF_08_HYP
GSM2607820
GP_NF_09_HYP
GSM2607821
GP_NF_11_HYP
GSM2607822
GP_NF_13_HYP
GSM2607823
GP_BM_16_HYP
GSM2607824
GP_BM_20_HYP
GSM2607825
GP_BM_21_HYP
GSM2607826
GP_BM_22_HYP
GSM2607827
GP_BM_24_HYP
GSM2607828
GP_BM_25_HYP
GSM2607829
GP_NM_18_HYP
GSM2607830
GP_NM_19_HYP
GSM2607831
GP_NM_23_HYP
GSM2607832
GP_NM_28_HYP
GSM2607833
GP_NM_29_HYP
GSM2607834
GP_NM_30_HYP
GSM2607835
GP_BF_01_KID
GSM2607836
GP_BF_02_KID
GSM2607837
GP_BF_05_KID
GSM2607838
GP_BF_12_KID
GSM2607839
GP_BF_14_KID
GSM2607840
GP_BF_15_KID
GSM2607841
GP_NF_03_KID
GSM2607842
GP_NF_06_KID
GSM2607843
GP_NF_08_KID
GSM2607844
GP_NF_09_KID
GSM2607845
GP_NF_11_KID
GSM2607846
GP_NF_13_KID
GSM2607847
GP_BM_16_KID
GSM2607848
GP_BM_20_KID
GSM2607849
GP_BM_21_KID
GSM2607850
GP_BM_22_KID
GSM2607851
GP_BM_24_KID
GSM2607852
GP_BM_25_KID
GSM2607853
GP_NM_18_KID
GSM2607854
GP_NM_19_KID
GSM2607855
GP_NM_23_KID
GSM2607856
GP_NM_28_KID
GSM2607857
GP_NM_29_KID
GSM2607858
GP_NM_30_KID
GSM2607859
GP_BF_01_LVR
GSM2607860
GP_BF_02_LVR
GSM2607861
GP_BF_05_LVR
GSM2607862
GP_BF_12_LVR
GSM2607863
GP_BF_14_LVR
GSM2607864
GP_BF_15_LVR
GSM2607865
GP_NF_03_LVR
GSM2607866
GP_NF_06_LVR
GSM2607867
GP_NF_08_LVR
GSM2607868
GP_NF_09_LVR
GSM2607869
GP_NF_11_LVR
GSM2607870
GP_NF_13_LVR
GSM2607871
GP_BM_16_LVR
GSM2607872
GP_BM_20_LVR
GSM2607873
GP_BM_21_LVR
GSM2607874
GP_BM_22_LVR
GSM2607875
GP_BM_24_LVR
GSM2607876
GP_BM_25_LVR
GSM2607877
GP_NM_18_LVR
GSM2607878
GP_NM_19_LVR
GSM2607879
GP_NM_23_LVR
GSM2607880
GP_NM_28_LVR
GSM2607881
GP_NM_29_LVR
GSM2607882
GP_NM_30_LVR
GSM2607883
GP_BF_01_OVR
GSM2607884
GP_BF_02_OVR
GSM2607885
GP_BF_05_OVR
GSM2607886
GP_BF_12_OVR
GSM2607887
GP_BF_14_OVR
GSM2607888
GP_BF_15_OVR
GSM2607889
GP_NF_03_OVR
GSM2607890
GP_NF_06_OVR
GSM2607891
GP_NF_08_OVR
GSM2607892
GP_NF_09_OVR
GSM2607893
GP_NF_11_OVR
GSM2607894
GP_NF_13_OVR
GSM2607895
GP_BF_01_PIT
GSM2607896
GP_BF_02_PIT
GSM2607897
GP_BF_05_PIT
GSM2607898
GP_BF_12_PIT
GSM2607899
GP_BF_14_PIT
GSM2607900
GP_BF_15_PIT
GSM2607901
GP_NF_03_PIT
GSM2607902
GP_NF_06_PIT
GSM2607903
GP_NF_08_PIT
GSM2607904
GP_NF_09_PIT
GSM2607905
GP_NF_11_PIT
GSM2607906
GP_NF_13_PIT
GSM2607907
GP_BM_16_PIT
GSM2607908
GP_BM_21_PIT
GSM2607909
GP_BM_22_PIT
GSM2607910
GP_BM_24_PIT
GSM2607911
GP_BM_25_PIT
GSM2607912
GP_NM_18_PIT
GSM2607913
GP_NM_19_PIT
GSM2607914
GP_NM_23_PIT
GSM2607915
GP_NM_28_PIT
GSM2607916
GP_NM_29_PIT
GSM2607917
GP_NM_30_PIT
GSM2607918
GP_BF_01_SKN
GSM2607919
GP_BF_02_SKN
GSM2607920
GP_BF_05_SKN
GSM2607921
GP_BF_12_SKN
GSM2607922
GP_BF_14_SKN
GSM2607923
GP_BF_15_SKN
GSM2607924
GP_NF_03_SKN
GSM2607925
GP_NF_06_SKN
GSM2607926
GP_NF_08_SKN
GSM2607927
GP_NF_09_SKN
GSM2607928
GP_NF_11_SKN
GSM2607929
GP_NF_13_SKN
GSM2607930
GP_BM_16_SKN
GSM2607931
GP_BM_20_SKN
GSM2607932
GP_BM_21_SKN
GSM2607933
GP_BM_22_SKN
GSM2607934
GP_BM_24_SKN
GSM2607935
GP_BM_25_SKN
GSM2607936
GP_NM_18_SKN
GSM2607937
GP_NM_19_SKN
GSM2607938
GP_NM_23_SKN
GSM2607939
GP_NM_28_SKN
GSM2607940
GP_NM_29_SKN
GSM2607941
GP_NM_30_SKN
GSM2607942
GP_BM_16_TES
GSM2607943
GP_BM_20_TES
GSM2607944
GP_BM_21_TES
GSM2607945
GP_BM_22_TES
GSM2607946
GP_BM_24_TES
GSM2607947
GP_BM_25_TES
GSM2607948
GP_NM_18_TES
GSM2607949
GP_NM_19_TES
GSM2607950
GP_NM_23_TES
GSM2607951
GP_NM_28_TES
GSM2607952
GP_NM_29_TES
GSM2607953
GP_NM_30_TES
GSM2607954
GP_BF_01_THY
GSM2607955
GP_BF_02_THY
GSM2607956
GP_BF_05_THY
GSM2607957
GP_BF_14_THY
GSM2607958
GP_BF_15_THY
GSM2607959
GP_NF_03_THY
GSM2607960
GP_NF_06_THY
GSM2607961
GP_NF_08_THY
GSM2607962
GP_NF_09_THY
GSM2607963
GP_NF_11_THY
GSM2607964
GP_NF_13_THY
GSM2607965
GP_BM_16_THY
GSM2607966
GP_BM_20_THY
GSM2607967
GP_BM_21_THY
GSM2607968
GP_BM_22_THY
GSM2607969
GP_BM_24_THY
GSM2607970
GP_BM_25_THY
GSM2607971
GP_NM_18_THY
GSM2607972
GP_NM_19_THY
GSM2607973
GP_NM_23_THY
GSM2607974
GP_NM_28_THY
GSM2607975
GP_NM_29_THY
GSM2607976
GP_NM_30_THY
This SubSeries is part of SuperSeries:
GSE98719
RNA-seq of breeding and non-breeding naked mole-rats and guinea pigs
Relations
BioProject
PRJNA385822
SRA
SRP106639
Download family
Format
SOFT formatted family file(s)
SOFT
MINiML formatted family file(s)
MINiML
Series Matrix File(s)
TXT
Supplementary file
Size
Download
File type/resource
GSE98653_GP_counts.xls.gz
6.7 Mb
(ftp)
(http)
XLS
SRA Run Selector
Raw data are available in SRA
Processed data are available on Series record
|
NLM
|
NIH
|
GEO Help
|
Disclaimer
|
Accessibility
|