NCBI Logo
GEO Logo
   NCBI > GEO > Accession DisplayHelp Not logged in | LoginHelp
GEO help: Mouse over screen elements for information.
          Go
Sample GSM118657 Query DataSets for GSM118657
Status Public on Aug 01, 2006
Title Patient 6 D7/D0
Sample type RNA
 
Channel 1
Source name sample D0 in Cy3
Organism Homo sapiens
Characteristics Peripheral blood mononuclear cells
Extracted molecule total RNA
Label Cy3
 
Channel 2
Source name sample D7 in Cy5
Organism Homo sapiens
Characteristics Peripheral blood mononuclear cells
Extracted molecule total RNA
Label Cy5
 
 
Description Patient = female
age = 64y
Organ failure = 2
SAPSII = 42
SOFA = 6
alive at D7
alive at D28
Inclusion delay = 3
Bacterial = not determined
Site of infection = cervical
Data processing Genesight and AIDA softwares; background substraction; spikes correction; ratio Cy5/Cy3; log10 ratio for transformation; Lowess normalization; ANOVA across all samples
 
Submission date Jul 06, 2006
Last update date Jul 07, 2006
Contact name Didier Payen de la Garanderie
E-mail(s) dpayen1234@aol.com
Phone 0033149958085
Fax 0033149958543
Organization name Hopital Lariboisiere
Department DAR-ICU
Street address 2 rue Ambroise Pare
City Paris
State/province --
ZIP/Postal code 75010
Country France
 
Platform ID GPL3916
Series (1)
GSE5271 Time evolution study of sepsis in patients at D1, D7 and D28 post-inclusion

Data table header descriptions
ID_REF
VALUE Normalized log ratio Cy3/Cy5
Cy3_SIG_Mean mean Cy3 signal
Cy3_BKG_Mean mean Cy3 background
Cy5_SIG_Mean mean Cy5 signal
Cy5_BKG_Mean mean Cy5 background

Data table
ID_REF VALUE Cy3_SIG_Mean Cy3_BKG_Mean Cy5_SIG_Mean Cy5_BKG_Mean
Z82244 0.333431610894182 238370.333333333 76358.9666666667 130231.333333333 55049.3333333333
Z17227 0.41907602168387 426570.333333333 84043.3 180876.333333333 50373.8333333333
XN_001687 null 89106 75170.5666666667 47269.3333333333 48183.1
XM_088248 null 78355.3333333333 72440.1333333333 47722 58791.5
XM_086400 0.605039335866361 8933447.66666667 72440.1333333333 2258898.33333333 58791.5
XM_086017 0.257321374513645 362359.666666667 75170.5666666667 206981.666666667 48183.1
XM_084034 0.18900989213926 81588 75170.5666666667 52336 48183.1
XM_083833 -0.532933816542297 72101 76358.9666666667 40523.6666666667 55049.3333333333
XM_059235 0.532823572749255 67524.3333333333 84043.3 45530.3333333333 50373.8333333333
XM_058179 -0.00755158304748763 81314.3333333333 84043.3 47597 50373.8333333333
XM_057491 0.525686182187946 325038 76358.9666666667 129172.333333333 55049.3333333333
XM_057445 null 85342.3333333333 84043.3 49071.3333333333 50373.8333333333
NM_000222 0.538385738256895 175215.666666667 72440.1333333333 88542.6666666667 58791.5
XM_057372 null 87105.6666666667 75170.5666666667 47011.6666666667 48183.1
XM_057356 0.833337484170199 234548.333333333 75170.5666666667 71576.3333333333 48183.1
XM_057158 0.0857806384716802 458976 72440.1333333333 376047 58791.5
XM_057131 0.556512108325859 399977.333333333 75170.5666666667 138363.666666667 48183.1
XM_056798 0.0334463315314852 140475.333333333 75170.5666666667 108647.333333333 48183.1
XM_056556 0.689158779006079 95233.3333333333 75170.5666666667 52287.3333333333 48183.1
XM_056009 -0.549800627602831 144270.333333333 84043.3 263969.333333333 50373.8333333333

Total number of rows: 340

Table truncated, full table size 26 Kbytes.




Supplementary data files not provided
| NLM | NIH | GEO Help | Disclaimer | Accessibility |
NCBI Home NCBI Search NCBI SiteMap